第三部分蛋白质的分子结件构及功能2009.ppt

锌指结构镶嵌于 DNA 双螺旋的大沟 类固醇激素受体的结构 (二) 蛋白质的三级结构 (tertiary structure) 蛋白质的三级结构是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置，即多肽链中所有原子 (包括主链和侧链) 在三维空间的排布位置。 稳定三级结构的化学键： 氢键 离子键 (盐键) Van der Waals 力 疏水作用 有些蛋白质的二硫键也是维系其三级结构稳定性的重要因素。 次级键 (非共价键 ) 氢键的结合力较弱，受温度、离子强度与 pH 的影响。 盐键是带电基团的相互吸引，受离子强度与 pH 的影响。 Van der Waals 力是原子间的相互吸引力。 疏水作用是非极性侧链之间排斥水而相互聚集的吸引作用。 蛋白质的结构域 (domain) 具有二级结构的多肽链，特别是长的多肽链在形成三级结构时，可能组合成数个相互连续而又相对独立的疏密不等的区域，各行使其功能，这些区域称为结构域。 Src 蛋白的三个结构域 SH2 和 SH3 分别识别、结合蛋白质的相关结构。 (三) 蛋白质的四级结构 (quaternary structure) 许多蛋白质含有两条以上具有独立三级结构的多肽链，这些多肽链通过非共价键相互连接形成的多聚体结构称为蛋白质的四级结构。每条具有独立三级结构的多肽链则称为此蛋白质的亚基 (subunit)。 氢键 离子键 (盐键) Van der Waals 力 疏水作用 稳定四级结构的化学键 血红素 成人血红蛋白由 2 条 ? 链和 2 条 ? 链组成，每一亚基含一个血红素分子。 血红蛋白的四级结构 (四) 蛋白质空间结构的确定 X 射线晶体分析 (X-ray crystallography) 核磁共振光谱分析 (nuclear magnetic resonance spectroscopy) 蛋白质结晶 三、蛋白质结构与功能的关系 1. 蛋白质一级结构的变化导致其空间结构及功能的改变。 镰刀型贫血的致病机理 Ala Ile Ser Thr 抹香鲸 Ala Ile Gly Thr 马 Ala Val Gly Ala 羊 Ala Val Ser Ala 牛 Ser Ile Ser Thr 兔 Ala Ile Ser Thr 狗 Ala Ile Ser Thr 猪 Thr Ile Ser Thr 人 B30 A10 A9 A8 　　氨基酸残基的差异部分 来 源 2. 一级结构差别很大的蛋白质可能有相似的空间结构 八种不同来源的胰岛素分子中存在氨基酸组成的差异，但不影响胰岛素的生物活性。 第三节 蛋白质的理化性质及其 提取、纯化原理 (一) 蛋白质的两性解离 在一定 pH 条件下，蛋白质所带的正、负电荷相等，净电荷为零，蛋白质成为兼性离子，此时溶液的 pH 称为该蛋白质的等电点。 一、蛋白质的理化性质 蛋白质 带正电荷 蛋白质 带负电荷 (二) 蛋白质的胶体性质 蛋白质的分子量为 10 - 1000 kD，分子直径为 1 - 100 nm，属胶体颗粒。 蛋白质是亲水胶体，球状蛋白质分子的亲水基团位于分子的表面，与水结合，形成包绕分子表面的水化膜。 蛋白质胶体稳定的因素： 水化膜 胶体颗粒表面的电荷 * 第三部分 蛋白质的组成及分子结构 1. 作为生物催化剂 (酶) 2. 代谢调节作用 3. 免疫保护作用 4. 物质的转运和存储 5. 运动与支持作用 6. 参与细胞间信息传递 蛋白质的生物学功能 蛋白质的分类 1. 根据蛋白质组成成分，可分为： 单纯蛋白质 不含有非蛋白质部分，水解后的最终产物只有氨基酸。 结合蛋白质 由单纯蛋白和辅基 (无机离子或有机化合物) 结合而成的蛋白质。 2. 根据蛋白质形状，可分为： 纤维状蛋白质 球状蛋白质 细胞色素氧化酶 铜 丙酮酸羧化酶 锰 钙调蛋白 钙 乙醇脱氢酶 锌 铁蛋白 铁 金属蛋白 琥珀酸脱氢酶 黄素核苷酸 (FAD、FMN) 黄素蛋白 血红蛋白、细胞色素 c 血红素 (铁卟啉) 血红素蛋白 酪蛋白 (casein) 磷酸基团 磷蛋白 核糖体 核酸 核蛋白 胶原蛋白、纤连蛋白等 糖基或糖链 糖蛋白 血浆脂蛋白 (VLDL、LDL、HDL等) 脂类 脂蛋白 举 例 辅 基 分 类 结合蛋白质及其辅基 第一节 蛋白质的基