关于宏基因组学猪群样本病毒探测方法建立_韩文.pdf

Research Paper 研究报告 微生物学报 A cta M icrobiolog ica Sinica 53 (2 ) :197 － 203 ; 4 Feburary 20 13 ISSN 000 1 － 6209 ; CN 11 － 1995 / Q http :/ / journals． im ． ac ． cn / actamicrocn 基 于宏基 因组学 的猪群样本病毒探测方法 的建立 * ， ， ， ， ， 韩文 罗玉子 赵碧波 孙元 李素 仇华 吉 ， ， 15000 1 中国农业 科学 院哈尔滨兽 医研究 所 兽 医生物技术国家重点实验室 哈尔滨 : ， ， 摘要 极其多 样 的病 毒广泛存 在 于我们 周 围的环境和 动 物 体内 其中 很 多病 毒 是人类 所 未知 的 而 发 现 未知 。 【 】 。 【 】 病 毒 常常受制于病 毒 常规检测 技术的局 限性 目的 构 建 未知 病 毒 检测 技术 平 台 方 法 应 用 病 毒 宏 基 ， ， ， PCR 因组学的理念 结合新型分子诊 断技术 首先利用 过 滤 和核酸酶 处 理 去除 样 品宿 主 核酸 干扰 然 后 随机 ， 。 【 】 扩增潜 在的病 毒宏基 因组 最后通过大 规模 测序及序列 分析获取病 毒核酸 信 息 结 果 利 用此 技术 我们 对 (CSFV) 2 (PCV2 ) ， 猪瘟病 毒 细胞培养 物 和 猪 圆环 病 毒 型 感 染 猪 病 料 进 行 了分 析 分 别 检 测 到 序 列 总 长 度 1680 bp ， 13. 7 % CSFV 834 bp ， 47. 2 % PCV2 ; 占基 因组 的 序列 和序列 总长度 占基 因组 的 序列 利 用此 检测 技 ， ， 56 26 5 术平 台研究一 未知病 原细胞培养物 通过 测序 和序列 分析 结果显示 条序列 中有 条 为副流感病 毒 型 (PIV5 ) ， 16. 4 % ; ， ， 同源 序列 覆盖 了其基 因组全 长 的 此 外 应 用本 研究 建 立 的方 法 结合新 一 代 高通 量 测 序