南海氨氧化古菌对初级生产力的贡献海洋生物学专业论文.docxVIP

目录2．3．2南海初级生产力的分布特征 目录 2．3．2南海初级生产力的分布特征 ．．30 2．3．3大肠杆菌14C-NaHC03培养验证实验 35 2．4讨论 j6 2．4．1南海原核生物自养固碳在黑暗海洋对初级生产力的贡献 ．．36 2．4．2利用14C．NaHC03研究原核生物对初级生产力贡献 ．37 第3章南海古菌accA(乙酰辅酶A羧化酶)基因多样性、丰 度及群落结构研究 ．．39 3．1研究背景 39 3．2材料与方法 4l 3．2．1采样 ．．4l 3．2．2 DNA提取 ．．43 3．2．3 PCR和qPCR分析 ．44 3．2．4多样性和系统发育分析 ．．45 3．2．5本研究使用的主要仪器设备和数据分析软件 ．．45 3．3结果 47 3．3．1环境因子分析 47 3．3．2多样性和系统发育分析 ．．47 3．3_3群落结构聚类分析 ．．52 3．3．4基因丰度的时空变化 ．．52 3．3．5原核生物固碳速率与奇古菌accA基因丰度的回归性分析 54 3．4讨论 ．55 3．4．1南海奇古菌是深海初级生产力的重要贡献者 ．．55 3．4．2古菌accA的分布特点与多样性 56 3．4．3 Cren529F／Cren981R引物测定奇古菌accA基因的偏好性 ．57 第4章珠江口古菌accA基因丰度研究 59 4．1研究背景 59 4．2材料与方法 ．59 4．2．1采样 ．59 万方数据 目录4．2．2 目录 4．2．2 DNA提取 ．．60 4．2．3 qPCR分耖i 60 4．2．4本研究使用的主要仪器设备和数据分析软件 ．．60 4．3结果与讨论 6l 4．3．1珠江口古菌accA基因的水平分布特点 61 4．3．2珠江口古菌accA基因的垂直分布特点 62 第5章主要结论、创新点、不足与展望 一64 5．1主要结论 64 5．2创新点 66 5．3不足与展望 66 参考文献 ．．68 致谢 ．82 万方数据 乃6le 乃6le of Contents Contents Abstract(in Chinese) ··I Abstract(in English) ·III Chapter 1 Introduction ··I I．I Marine primary production I 1．I．I The defination ofprimary production ．．1 1．1．2 Marine primary production 1 1．1．3 The research significance ofmarine primary production ．．2 1．1．4 The influencing factors ofmarine primary production 3 1．1．5 The research status ofmarine primary production in our country ．3 1．1．6 Reasearch methods ofmarine primary production 5 1．1．7 The research statIls ofdark ocean ．．6 1．2 Carbon fixation pathways ．．7 1．3 Autotrophic carbon fixation in planctonic thaumarchaeota．．． ．．．． ． ··15 1．3．1 The importance and research field ofarcheae．．．．． ．．．． ．．． ．．15 1．3．2 Amonia oxidation and autotrophic carbon fixation in砌口“，以口，．c^口已Df口 17 1．4 Design and research significance of this thesis ·19 Chapter 2 Using 14C—NaHC03 method to investigate the contribution of prokaryotes to the primary production．．．． ．．．···20 2．1 Background 20 2．2 Materials and Methods 22 2．2．1 Sampling ．．22 2．2．2 The process of 14C-NaHC03 incubation experiment 24 2．2．3 Data analysis ． ． ．．． ． ．． ．．．．．．27 2．2．4 Reagents and devices involved in th