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松江鲈遗传多样性分析本科毕业.doc
W I.
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本科毕业论文
题目 松江鲂遗传多样性分析
系(院) 生物与食品工程系
年 级 2004级 专 业 生物科学(师范)
班级 (2)班学号 060104210
学生姓名 鲍峰
指导教师 郁建锋职称 讲师
论文提交日期
2008年6月5日
松江餉遗传多样性分析摘要
本研究通过止交实验设计,分别从TagDNA聚合酶、Mg2+ dNTPmix和引物4种PCR 原料因素的3个水平,筛选并确立了松江鲂ISSR- PCR反应最佳体系,并通过温度梯度 PCR,确立了适于的退火温度。结果表明,利用所建立的ISSR-PCR反应体系,对松江缈 样本进行检验,获得了清晰、重复性好、多态性高的DNA谱带。
从77个ISSR引物屮筛选出4个引物,对松江缈2个群体(辽宇丹东野生群体、河北 秦皇岛F1代人工繁育群体)共48个样品进行扩增,共得到44个清晰的扩增位点,其中 多态性位点37个,多态位点百分率为84.09%。Popgene分析结果表明:丹东野生群体的 遗传多样性水平(P=79.55%, h=0.2750, 1=0.4100)略高于人工繁育群体的遗传多样性水平。 松江鲂48个个体间最大的遗传距离为0.8389,个体间最小的遗传距离为0.0465, 48个个体 的平均遗传距离为0.3525;群体间的NeFs遗传分化系数为0.0876;利用MEGA3.0软件构 建了松江鲂48个个体的UPGMA系统树,松江鲂个体不以地理群体分别聚类,无明显分 支。研究表明松江鲂种群的遗传多样性处于中等水平,2个群体的遗传分化尚未达到种群 的分化水平。
本文从分子遗传学入手,采用ISSR分子标记技术分别对松江餉的野生与人工繁育群 体进行遗传多样性研究,为其种质资源的科学管理、研究野生松江缈的遗传背景和比较野 生群体与人工繁育群体Z间的遗传差异以及探讨由于辽东半岛沿岸带有较多松江鲂分布 而产牛的基因交流对2个群体遗传结构的影响提供了重要理论依据。
关键词:松江缈正交试验ISSR遗传多样性
Study on the genetic diversity of Trachidermus fasciatus
Abstract
ISSR technique was used to assess the genetic diversity of two populations (24 wide individuals from the Yalu River, and 24 cultured individuals from the Qinhuang Island). In this study, orthogonal design was used to optimize ISSR amplification system on Trachidermus fasciatus Heckel in four factors (Taq DNA polymerase, dNTP,primer, Mg) at three levels respectively. Therefore best reaction systems could be established. And the optimal annealing temperature 51 °C for ISSR-PCR reaction was proposed by gradient PCR. The clear and polymorphic DNA bands were amplified repeatedly from 24 wild Trachidermus fasciatus Heckel by the established ISSR amplification system.
The genetic diversity of 48 samples from two populations (24 wide individuals from the Yalu River, and 24 cultured individuals from the Qinhuang Island ) were studied using the inter-simple sequence repeat (ISSR) markers. The ISSR bands can be differentiated highly in 4 primers after screening. A total of 37 discernible DNA fragments were observed, among which 44 fragments(84.09%) being polymorphic? The percent
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