番茄RGA4蛋白与马铃薯Rpi－blbl蛋白的同源比较分析.pdf

广 西 植 物 Guihaia Jun．2O15，35(3)：420—427 http：／／journa1．gxzw．gxib．cn DOI：10．11931／guihaia．gxzw201403048 武安泉，王俊生，阮先乐，等．番茄 RGA4蛋 白与马铃薯Rpi—blbl蛋 白的同源 比较分析[J]．广西植物 ，2015，35(3)：42O一427 WuAQ，WangJS，RuanXI，eta1．HomologyanalysisoftomatoRGA4andpotatoRpi—blblprotein[J~．Guihaia，2015，35(3)：42O 427 番茄RGA4蛋白与马铃薯Rpi-blbl蛋白的同源比较分析 武安泉，王俊生 ，阮先乐，范小芳，陈 龙 (周 口师范学院 生命科学与农学学院，河南 周 口466001) 摘 要 ：为获得番茄抗晚疫病广谱性基因信息，采用同源电子克隆法 ，基于番茄蛋白序列数据库 ，以马铃薯晚 疫病广谱抗性蛋 白Rpiblbl为种子序列 ，获得番茄疾病抗性蛋 白RGA4，并进行基因电子定位和基因结构、模 体 、二级结构 、基因进化及基因电子表达等分析，以证明两者 的进化关 系。结果表明：番茄 RGA4蛋 白(XP一 004245923．1)序列具有NB—ARC和 LRR两个保守结构域 ，定位于第 8条染色体 SL2．40区间，相应基因位于 8 号染色体序列57232935bp区间，长度为 4089bp，由 2个外显子和 1个 内含子组成 ，编码 988 个氨基酸序列 ，该蛋 白为不稳定分泌球形蛋 白；番茄 RGA4蛋 白和马铃薯 Rpiblbl蛋 白在二级结构分布、基 因序列组成、基因定位等方面相似性较高 ，可确定两者为垂直同源关系，但在基因进化和模体组成方面存在差 异，可能导致两者功能上的不同。研究结果可为番茄晚疫病广谱抗性基因克隆及其利用提供理论依据 。 关键词 ：番茄；晚疫病；垂直同源 ；生物信息学分析 中图分类号 ：Q943．2；$641．2 文献标识码 ：A 文章编号：1000—3142(2015)030420—08 potatoRpi__blblprotein WU A Quan，WANG Jun-Sheng，RUAN Xian-Le，FAN Xiao-Fang，CHEN I．ong ‘CollegeojL“esciencesandAgri~’ulture，ZhoukouNormalUniversity，Zhoukou466001，China Abstract：Usingelectroniccloningmethod，theputativediseaseresistanceproteinRGA4andthehomologueofthe potatoRpiblblproteinwereobtainedfrom tomato’SproteinsequencesdatabaseinNCBIbyproteinblastwhenthe sequenceoflateblightresistantproteinRpi—blblfrom potatowasusedasquerysequence，then，theywerecompared ingenemapping，genestructure，modify，secondarystructure，topologicalstructureandelectronicgeneexpressionpro file，ete，forprovingtheirevolutionaryrelationship．TheresultshowedthattomatoRGA4protein (XP 004245923．1)