基于单分子蛋白质测序芯片的研究-集成电路工程专业论文.docxVIP

万方数据 万方数据 上海交通大学 学位论文原创性声明 本人郑重声明:所呈交的学位论文《基于单分子蛋白质测序芯 片的研究)) ，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成 果。除文中己经注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集 体已经发表或撰写过的作品成果。对本文的研究做出重要贡献的个人 和集体，均己在文中以明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律 结果由本人承担。 学位论文作者签名 : gflfi而 日期: 7JJ g年 j 月? 日 上海交通大学 学位论文版权使用授权书 本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定， 同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版， 允许论文被查阅和借阅。本人授权上海交通大学可以将本学位论文的 全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫 描等复制手段保存和汇编本学位论文 。 保密口，在 年解密后适用本授权书 。 本学位论文属于  不保密d (请在以上方框内打 ../ ) 学位论文作者签名 : BfifJ ;J马 指导教师签名 :叫得5 日期: 7P 1夕年 !月 I 日 日期:rT 1 f 年 f 月 1 于日 上海交通大学硕士学位论文 上海交通大学硕士学位论文 基于单分子蛋白质测序芯片的研究 摘要 本文主要介绍了一种对于 DNA 测序技术的改良性试验，是基于单 分子蛋白质生物芯片的制备，这种生物芯片可以应用于 DNA 序列的检 测。在本课题中，制备出了 DNA 测序所需要生物芯片，总结出了制备 此种芯片的实验步骤和实验过程中各种参数。 本文主要研究了生物芯片的制备工艺和生物学处理，将实验所需 要的纳米级别的生物芯片的器件成功的制备出来。首先通过软件将生 物芯片所需的纳米阵列设计出来，再通过电子束光刻、聚焦离子束刻 蚀等过程制备出器件，运用了生物素-链霉亲和素系统将蛋白质分子按 照设计阵列分布于镀膜硅片表面，从而用于下一步的 DNA 测序。 本文工作在于将测试系统固定于样品表面；通过聚焦离子束刻蚀 纳米坑，减小纳米坑直径和所沉积金属膜的厚度，从而来模仿在样品 表面进行 DNA 单链测序。 本实验所运用的 DNA 测序生物芯片的制备，无论是微纳米加工工 艺还是生物处理步骤都已经相对完善，如何进一步优化工艺流程、对 蛋白质分子的优化和利用此生物芯片的 DNA 测序过程的展开，将是本 课题今后探索的方向。 关键词：DNA 测序，单分子，纳米阵列，生物素 1 A RESEARCH OF SEQUENCING CHIP WITH SINGLE MOLECULE PROTEIN ABSTRACT This paper mainly introduces the research about DNA sequencing. This experiment which has a lot of improvements for the third sequencing generation bases on single protein molecule biochip. The biochip can be applied to DNA sequencing. In my project, successful fabrication of wafer designed before the experiment is preparation for the biological chip that has certain functions. The parameters and experiments procedures are all in summary. Biological treatment and fabrications of the chip are mainly introduced in order to prepare successfully for the next experiment. First of all, nano array is designed by software and the device with array is prepared by electron beam lithography. To do the DNA sequencing, the system of biotin and streptavidin arranges protein molecules as designed. Experiments are processed in the nanowells in the third-generation DNA sequencing. Innovation of t