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增强子作用机理: (3)沉默子:某些基因含有负性调节元件——沉默子,当其结合特异蛋白因子时,对基因转录起阻遏作用。 (三)反式作用因子 1、定义:能直接或间接地识别或结合在各类顺式作用元件核心序列上,参与调控靶基因转录效率的蛋白质。 TFⅡD(TATA)、CTF(CAAT)、SP1(GGGCGG)、HSF(热激蛋白启动区) 转录因子的类型 1)基本转录因子(Basal factor): 和RNA聚合酶一起结合于起始点和TATA盒; 2)激活剂(activator): 特异性识别短共有序列元件的转录因子。它们结合于启动子或增强子位点上。通过增加基本转录复合体(basal apparatus)结合于启动子的效率而起作用; 3)辅激活剂(coactivator): 连接了激活剂和基本转录复合体; 4)一些调节因子(Some regulators): 可使染色质结构改变。 2、结构 DNA结合结构域 转录活化结构域 结构域 连接区 (1)DNA结合结构域: 螺旋-转折-螺旋(Helix-turn-helix,H-T-H) 锌指结构(zinc finger) 碱性-亮氨酸拉链(basic - leucine zipper) 碱性-螺旋-环-螺旋(basic – helix /loop /helix,bHLH) 同源域是一个DNA结合域,它由60个氨基酸组成,并形成3个α螺旋。C端的α螺旋有17个氨基酸,它结合DNA大沟。同源域N端臂插入DNA小沟。 含同源域的蛋白质可能是转录的激活剂或阻抑物。 1、螺旋-转折-螺旋(helix-turn-helix) 现广泛分布在从酵母到人类的各种真核生物中,虽彼此在氨基酸的顺序上差别很大,但高级结构高度保守。 Helix 3 of the homeodomain binds in the major groove of DNA, with helices 1 and 2 lying outside the double helix. The N-terminal arm lies in the minor groove, and makes additional contacts. 2、锌指结构 配位键 2-9个 定义:是一种常出现在DNA结合蛋白中的结构基元。是由一个含有大约30个氨基酸的环和一个与环上的4个Cys或2个Cys和2个His配位的Zn构成,形成的结构像手指状。 “锌指”是根据其结构命名的,其中一小段保守氨基酸与Zn2+结合,形成一个相对独立的区域。有两类DNA结合蛋白含有这种结构: 1)经典的“锌指”蛋白质 2)类因醇受体 1)经典的“锌指”蛋白质 典型“锌指蛋白”含有一连串锌指。 单个锌指共有序列如下图所示: Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-X5-Leu-X2- His-X3-His 称为Cys2/His2锌指。 转录因子SP1 (GC盒) 、连续的3个锌指重复结构。 谨慎理解锌指存在的意义: 尤其是蛋白质仅含有单个锌指时,锌指可能参与RNA的结合而不是DNA结合,或它与任何核酸结合活性均无关。 2)类固醇受体 类固醇受体(?Steroid receptors)是配体应答的激活剂,它通过结合类固醇(或其他相关分子)而激活。它们有独立的DNA结合域和配体结合域。 类固醇受体的DNA结合域是一类锌指: Cys-X2-Cys-X13-Cys-X2-Cys 被称为Cys2/ Cys2锌指。 如糖皮质激素受体和雌激素受体各含两个锌指。 配体的结合使得受体(如类固醇受体)能够结合应答元件: 配体结合于受体的C端结构域,提高了DNA结合域对DNA特异靶位点的亲和力。 3、碱性-亮氨酸拉链 二聚体 亮氨酸之间相互作用形成二聚体,形成“拉链” 。 肽链氨基端20~30个富含碱性氨基酸结构域与DNA结合。 这类蛋白质的DNA结合结构域实际是以碱性区和亮氨酸拉链结构域整体作为基础的。 这种基序含有4-8个亮氨酸,每两个亮氨酸由6个氨基酸间隔。 4、碱性-螺旋-环-螺旋 DNA结合蛋白有两个共同特征,即存在结合DNA的螺旋区和形成蛋白质二聚体的能力。螺旋-环-螺旋蛋白同时具有这两特征。 除个别情况外,大多数转录因子一旦同DNA结合,便会通过其他因子或RNA聚合酶之间的相互作用,激发靶基因进行转录。这是因转录因子中存在着一种特殊的功能结构域,即常说的转录激活域(Transcriptional activation domain) (2) 反式作用因子中的转录激活域 1酸性激活域 它们之间并不存在较为明显的氨基酸序列的同源性,但却都含有高比例的酸性氨基酸,产生
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