《非编码RNA数据库及在线分析工具》-03 miRNA相关数据库.docxVIP

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  • 2019-07-06 发布于天津
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《非编码RNA数据库及在线分析工具》-03 miRNA相关数据库.docx

miRNA相关数据库 : EVmiRNA( HYPERLINK /EVmiRNA /EVmiRNA), 提供三个功能模块:(i)miRNA表达谱和来自不同来源(例如血液、母乳等)的EV的样品信息;(ii)不同EV中特异性表达的miRNA,有助于生物标志物鉴定;(iii)miRNA注释,包括EV和TCGA癌症类型中的miRNA表达,miRNA通路调节以及miRNA功能和出版物。EVmiRNA具有用户友好的Web界面,具有强大的浏览和搜索功能,以及数据下载。它是第一个专注于EV中miRNA表达谱的数据库,可用于EV生物标志物、miRNA功能和液体活检的研究和应用领域。 miR2Disease,( HYPERLINK / /) 一个手工打造的数据库,旨在提供一个全面的microRNA对应各种人类疾病的资源。其中的每个条目包含miRNA-disease关系的详细信息,包括microRNA的ID、疾病名称、miRNA-disease关系的简要描述、microRNA在不同疾病状态的表达模式、microRNA的表达检测方法、通过实验验证microRNA的目标基因和参考文献。 mirWalk: (http://zmf.umm.uni-heidelberg.de/apps/zmf/mirwalk/ ) 查找通路中的miRNA以及其靶基因,并且能够查询疾病相关miRNA。 HMDD: (/hmdd ) 提供与疾病相关的miRNA以及其靶基因,在通路分析的时候解列mirWalk非常有用。 DIANA:(http://diana.imis.athena-innovation.gr/DianaTools/index.php?r=site/pageview=software ) 这是非常综合的关于miRNA分析的工具厂。 CoGeMiR( HYPERLINK http://cogemir.tigem.it/ http://cogemir.tigem.it/) 数据库总结关于在进化过程中MicroRNA?在不同动物中的保守性。该数据库搜集已知的和预测的microRNA关于染色体定位、保守性和表达谱方面的信息。

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