一种不对称菁染料及其与不同结构DNA的相互作用-ChemicalJournal.PDFVIP

Vol.35 高等 学校 化 学 学报 No.10 2014年10月 摇 摇 摇 摇 摇 摇 CHEMICALJOURNAL OF CHINESE UNIVERSITIES摇 摇 摇 摇 摇 摇 2085~2092 doi:10.7503/ cjc 摇 摇 一种不对称菁染料及其与不同 结构DNA 的相互作用 1,2 2 2 2 2 1 2 吴尚荣 ,金摇 冰 ,张摇 楠 ,柳摇 影 ,刘祥军 ,李松青 ,上官棣华 (1. 湘潭大学化学学院,湘潭411100; 2. 北京分子科学国家实验室,中国科学院化学研究所活体分析化学院重点实验室,北京 100190) 摘要摇 为考察小分子配基与不同核酸结构的结合机理,发展新的核酸探针分子,合成了一种新型一次甲基 不对称菁染料(MTP). 吸收光谱、荧光光谱及圆二色光谱研究结果表明,MTP可与平行和混合平行 G鄄四链 + 体DNA(如c鄄myc和22AGK )较强地结合,并引起130~180倍的荧光增强;其与单/ 双链DNA作用较弱,导 + 致40~60倍荧光增强;而与反平行G鄄四链体DNA(如TBA和22AGNa )的作用最弱,只引起15~25倍荧光 增强;以上结果表明MTP可作为荧光探针分子用于区别不同结构的核酸分子. 结合机理研究表明,平行和 混合平行G鄄四链体DNA优先通过沟槽结合模式结合1分子MTP,再通过末端堆积模式结合另1分子MTP. 关键词摇 菁染料;核酸;G鄄四链体;荧光分子探针;核酸配基 中图分类号摇 O652郾3 摇 摇 摇 摇 文献标志码摇 A 核酸是生物体中主要的遗传物质. 生物体中的核酸链包括单链、双链、三螺旋和四链体等多种结 构,这些结构之间相互联系、转化,在机体的生长、发育和繁殖等生命过程中起着重要作用,也是药物 研究的重要作用靶点. 因此,研究不同的核酸结构与小分子的相互作用对发展灵敏检测核酸的分子探 针和设计靶向核酸的治疗药物均具有重要意义. 有些菁染料可与各种核酸分子相互作用,并产生强的 [1,2] [3] 荧光变化 ,如噻唑橙(TO)及其衍生物、 SYBR Green 和ETC[3,3忆鄄di(3鄄sulfopropyl)鄄4,5,4忆,5忆鄄 [4,5] dibenzo鄄9鄄ethylthiacarbocyanine triethylammonium salt] 等. 这些菁染料在水溶液中的荧光量子产率非 常低,与核酸结合后荧光量子产率显著增加,因此被作为分子探针广泛用于核酸的分析、检测与结构 [6,7] 研究 . 此外,菁染料具有光谱范围广、摩尔消光系数大和灵敏度高等优点,已成为目前核酸荧光探 [8,9] 针研究的热点 . 不同的菁染料与核酸具有不同的相互作用,本文合成了一种新的一次甲基不对称 菁染料———1,2鄄二甲基鄄6鄄[3鄄甲基苯并[d]噻唑鄄2(3H鄄亚基)甲基]吡啶鄄1鄄鎓盐(MTP),并对其与不同 核酸结构的相互作用进行了研究. 1摇 实验部分 1.1摇 试剂与仪器 2,6鄄二甲基吡啶、2鄄氨基苯并噻唑、三氟甲磺酸甲酯、碘甲烷、2鄄甲基苯并噻唑和三羟甲基氨基甲 烷等均购自百灵威试剂有限公司. 常用溶剂及其它常见化学试剂购自北京化工厂. 实验所用DNA序列 均由上海生物工程技术服务有限公司合成及纯化. 所用缓冲液均由超纯水(18郾2 M赘 ·cm)配制. +