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死亡相关蛋白激酶基因启动子甲基化特异性PCR法
【摘要】目的:建立甲基化特异性PCR(MSP)技术检测死亡相关蛋白激酶(DAPK)基因启动子甲基化。方法:设计针对DAPK基因启动子的MSP引物,建立MSP检测体系对甲基化阳性模板进行检测,评价其特异性、重复性和灵敏性,并经测序鉴定。结果:所建立的甲基化MSP方法仅能扩增出甲基化阳性模板,不能扩增出未甲基化阳性模板和未硫化处理的DNA模板;对不同梯度稀释的甲基化阳性模板进行检测,其最大敏感性可达2%;在不同时间进行甲基化MSP检测的结果均一致。结论:成功建立的DAPK基因启动子甲基化MSP检测方法具有良好的特异性、灵敏性和重复性,可用于肿瘤标本的批量检测。
【关键词】死亡相关蛋白激酶;甲基化特异性PCR;甲基化
Establishmentandpreliminaryapplificationofmethylation瞫pecificPCRfor
detectingmethylationofdeath瞐ssociatedproteinkinasepromoter
WANGYa瞝i1,YAODong瞞ing1,LINJiang1,QIANJun1,XUWen瞨ong2,
QIANZhen1,ZHUZhao瞙ui1,XIAOGao瞗ei1,WUChao瞴ang1,JIANGPeng瞔heng3
(1.DepartmentofHematology,AffiliatedPeople′sHospitalofJiangsuUniversity,ZhenjiangJiangsu212002;2.SchoolofMedicalTechnology,JiangsuUniversity,ZhenjiangJiangsu212013;3.DepartmentofGeneralSurgery,AffiliatedPeople′sHospitalofJiangsuUniversity,ZhenjiangJiangsu212002,China)
[Abstract]Objective:Toestablishthemethylation瞫pecificPCR(MSP)forthedetectionofpromotermethylationofdeath瞐ssociatedproteinkinase(DAPK)gene.Methods:TheprimersofMSPaimingattheDAPKpromoterweredesigned.MSPwasestablishedtodetectthemethylationpositiveDNAtemplates.Thespecificity,sensibilityandrepeatabilitywereevaluated.Results:TheestablishedmethylatedMSPcouldonlyamplifythemethylationpositiveDNAtemplate,butnottheunmethylatedDNAtemplateandunmodifiedDNAtemplate.Inaseriesofdilution,methylatedMSPcoulddetect2%methylationpositiveDNAtemplates.Theamplifiedresultsofsamesamplewereidenticalondifferenttime.Conclusion:ThemethylatedMSPtechniquefordetectingofDAPKmethylationwasestablishedsuccessfullyandcanbeusedforanalyzingsamplesfromcancerpatients.
[Keywords]death瞐ssociatedproteinkinase;methylation瞫pecificPCR;methylation
死亡相关蛋白激酶(death瞐ssociatedproteinkinase,DAPK)是一种相对分子质量为160kDa的钙调蛋白依赖的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,DAPK是一种正性细胞凋亡调节因子,作为抑癌基因通过多种途径诱导肿瘤细胞凋亡,动物模型研究发现DAPK能够在肿瘤发育的早期阶段抑制细胞转化、并且能够抑制晚期转移事件[1]。近年来对造血系统肿瘤的研究揭示伯基特淋巴瘤(BL)、滤泡性淋巴瘤(FL)、弥漫大B细胞性淋巴瘤(DLBCL)[2,3]、急性髓细胞白血病(AML)、骨髓增生异常综合征(MDS)[4]、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)[5]同样存在着较高频率的DAPK基因启动子甲基化。此外,研究发现DAPK基因启动子异常甲基化与消化道、泌尿
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