SYBYL软件与计算机辅助药物设计精典课件.ppt

SYBYL软件与计算机辅助药物设计;美国Tripos公司是业界非常著名的高科技公司。 Tripos 的主营业务包括三个方面：  新化合物研发软件产品 软件咨询服务 新化合物的研发与销售世界上最大的15家制药公司都购买了Tripos的软件产品作为重要的研究手段。;Tripos Research and Service;User Lists-高等院校;User Lists-高等院校;中国科学院上海药物研究所 中国科学院上海有机研究所计算机化学开放实验室 中国科学院上海有机研究所国家生物有机及天然产物重点实验室 中国科学院贵州省天然产物化学重点实验室 中国科学院上海生物工程研究中心 中国科学院化工冶金研究所计算机化学开放实验室 中国科学院昆明动物研究所 中国科学院昆明植物研究所 中国科学院武汉物理研究所 中国科学院广州化学研究所 中国科学院长春应用化学研究所 中国科学院上海分院;中国医学科学院北京药物所有机合成室 中国医学科学院北京药物所国家药物及代谢产物分析研究中心 中国医学科学院天津血液学研究所 北京药物化学研究所北京微生物流行病研究所 四川抗菌素研究所 上海医药工业研究院 上海转基因研究所 江苏农药研究所 东北制药集团 山东大学药学院 南京大学化学院 天津药物研究院 军事医学科学院 ;药物研发的进程;第一个SBDD方法设计的新药碳酸酐酶抑制剂Dorzolamide (治疗青光眼疾病)于1994年上市 Wellcome公司用CADD方法设计的5－HT1D受体激动剂 311C90 (治疗偏头痛) ，进入三期临床研究 美国Eli Lilly公司开发的第一个高效、高选择性人体非胰腺分泌型磷脂酶抑制剂LY311727,进入临床研究 4个已上市的HIV-1蛋白酶抑制剂类药物的研制过程中，计算机辅助药物设计起了重要作用 2个凝血酶抑制剂已进入临床研究 Glaxo开发的唾液酸酶抑制剂4-胍基Nen5Ac2en (抗感冒药物)进入临床研究 治疗糖尿病药物(醛糖还原酶抑制剂)上市;Tripos Software;SYBYL? and UNITY? Solutions; ;Molecular Modelling Visualisation分子建模与可视化;SYBYL;MOLCAD;Advanced Computation;QSAR ADME定量构效关系与药动学性质预测;QSAR ADME;QSAR 的工作原理;Structures + Activity;QSAR - 3D QSAR - CoMFA;CoMFA - Interpretation;ADME -- VolSurf;Descriptors - visualisation;Pharmacophore Perception药效团分析;What is a Pharmacophore?;药效团分析模块的应用;DISCOtech 的工作原理 ;How does GASP work?;Chemical Informatics化学信息学 ;Unity;Unity example - 2D searching;Unity example - similarity searching;Biomolecular Software;生物大分子显示，修改，优化;Composer（同源模建）;GeneFold（高级穿线法）;FUGUE（远程同源模建）;ProTable （合理性分析）;Virtual Screening虚拟筛选;Δ G=-RTlnKi;成功案例;FlexX的优点;工作原理;FlexX – 唾液酸酶;CScore;PPAR-基因转录因子，以配体激活方式调控脂肪细胞分化。 PPARγ激动剂是很有前途的胰岛素增敏剂,2种新药2000年FDA批准在美国上市，其中罗格列酮(GSK)销额$10亿(2000～2001年）。;Database;PPAR? (Peroxisome proliferator-activated receptor);;PPAR??DDDC-P-06 complexes;Molecular Diversity Combinatorial Chemistry;Legion/CombiLibMaker;Selector - Filtering;DescriptorsFingerprints/Holograms;DescriptorsCoMFA Fields;Selector - Diversity Selection;DiverseSolutions - Diversity Selection;Thanks!