细胞色素COⅠ的研究概述【文献综述】.docVIP

毕业论文文献综述 水产养殖 细胞色素COⅠ的研究概述 摘要：本文简述了细胞色素C氧化酶Ⅰ（COⅠ）的结构功能，总体介绍了COⅠ的研究现状，并在分子生物水平的基础上，主要论述了COⅠ基因序列差异的研究在遗传学和病害学上的影响，特别是其在鱼类分类鉴定上所发挥的重要作用。 关键词：鱼类；细胞色素C；COⅠ；基因序列 在生物的线粒体中广泛存在着一种具有自动氧化作用的物质，即细胞色素氧化酶(Cytoehrome oxidase,COX)。COX由13个亚基组成，其中最大的3个亚基（CO1、CO2、CO3）来源于线粒体，其序列具有高度的保守性，分别由2个线粒体基因编码CO1和CO2是COX的两个催化中心（钟涛等，2002）。COⅠ作为细胞色素C氧化酶具有酶催化活性的3大亚基之一，是mtDNA编码的最大亚基（谭小玲等，2002），且分子结构简单，检测便捷，具有严格而又典型的母性遗传，难以发生重组，可用于种群间、种、属间甚至科间的系统发育等研究（肖武汉等，2000）。 1研究背景 1930年，英国生物化学家凯林在心肌提取物中就已经发现细胞色素C氧化酶在电子传递链上的活性。2003年初，加拿大圭尔夫大学的生物学家保罗·赫伯特(Paul Hebert)和他的同事在《英国皇家学会学报B辑》上发表了一篇论文，提出用细胞色素C氧化酶I基因片段作为鉴别不同物种的“条码”。 十年前，用一种简便易行的方法把物种一一归类似乎是一项不可能的任务，但21世纪以来，随着基因工程的突破性发展，人们开始在分子水平上了解细胞色素C氧化酶的分子结构，发现细胞色素C氧化酶具有很大的保守性，而细胞色素C氧化酶Ⅰ基因序列进化速度适宜，把它的基因片段制成DNA条码最为适合，从而让地球上所有的物种都能拥有一份独特的“身份证”，用以辨别各自属于哪种种类，而且还能用其推测出分类阶元间的系统发育关系（Ostermeier C et al，1996；Wu W et al,2000；李连之等，2001；王中华等，2010）。 鱼类是脊椎动物中最原始而在种属数量上又最占优势的类群，其物种繁多，分布广泛，起源复杂，研究其遗传分化，阐明其进化途径，历来是令人饶有兴趣的课题。近年来，随着分子生物学技术向生物学各研究领域渗透，从分子水平，研究鱼类的遗传与进化，已越来越引人注目。其中对鱼类COⅠ的研究将会影响到其分类学，遗传学及疾病学的发展，能为渔业资源有序利用和保护提供参考，又因为鱼类的分类鉴定蕴含着巨大的利益，因此将会有越来越多的人对鱼类COⅠ感兴趣（杨学明等，2006；杨天燕等，2007）。 2研究现状 2.1鱼类分类学方面 多年以来，生物分类学家一直在寻找能够迅速区分不同物种的方法。传统的分类学鉴定依赖于针对物种外观或者解剖特征的识别，这种方法既费时费力，又可能出现错误。传统分类学并不能准确具体地分类鉴别出生物种类。有时传统分类划分的同一物种却属于几个物种。如：传统分类学认为的哥斯达黎加一种蝴蝶，用COI基因片段检验却鉴定出其中包含了十几个属。如果每一个物种都携带有表明自己身份的“条码”，那么物种分类和鉴定工作将得到很大简化。COⅠ是生物分子系统学研究和群体遗传分化的重要标志，其进化速度适宜且有较大的保守性，COI的基因约650个碱基，很适合作为动物分类学与生态学的DNA barcode（Murgia R et al，2002）。 虽然采用COI基因作为DNAbarcode所隐含的涉及线粒体的进化历史、遗传特性和物种成种时间的默认前提并非完全成立，但目前在动物中最常用的DNAbarcode就是细胞色素c氧化酶1号基因（COI）的部分序列（关申民等，2000）。且随着标准数据库的建立，基于COI基因的DNAbarcode在动物分类学和生态学中得到了广泛应用。近年来，COI作为扫描生命的条码，已被广泛用于鱼类、昆虫、鸟类等动物的鉴别分类研究。 现今，因COI条码序列获取很便捷，广泛适用硬骨鱼类物种鉴别，并可用于低级分类阶元的系统进化分析（ HYPERLINK /asp/vipsearch.asp?Query=%C1%F5%B3%FE%CE%E1Type=A 刘楚吾等，2009），如：由青石斑鱼COⅠ与线纹刺尾鲷COⅠ同源性很高，可判断青石斑鱼与线纹刺尾鲷亲缘性很高（施大卫等，2009）；对采自东海的银鲳、翎鲳和中国鲳3种鲳属鱼类的线粒体COI基因序列片段进行研究，能从分子水平研究中国东海海域鲳属鱼类的分类、遗传关系和系统进化，以其了解鲳属鱼类以及与鲳科之间的亲缘关系，又为鲳属鱼类保护生物学和系统进化提供分子生物学依据（张凤英等，2008）；更有人研究了基于线粒体CO1基因序列的DNA条形码在鲤科鲌属鱼类物种鉴定中的应用（彭居俐等，2009）。因此，虽然现在对于用COI基因片段作为鱼类分类鉴定