黄鲫分子标记开发及遗传多样性分析-海洋生物学专业毕业论文.docxVIP

浙江海洋学院 论文原创性声明 本人声明，所呈交的学位论文系在导师指导下本人独立完成 的研究成果。文中依法引用他人的成果，均已做出明确标注或得 到许可。论文内容未包含法律意义上已属于他人的任何形式的研 究成果，也不包含本人已用于其他学位申请的论文或成果。 本人如违反上述声明，愿意承担以下责任和后果： 1.交回学校授予的学位证书； 2.学校可在相关媒体上对作者本人的行为进行通报； 3.本人按照学校规定的方式，对因不当取得学位给学校造成 的名誉损害，进行公开道歉； 4.本人负责因论文成果不实产生的法律纠纷。 论文作者签名： 日期： 年 月 日 浙江海洋学院 论文知识产权权属声明 本人在导师指导下所完成的论文及相关的职务作品，知识产 权归属浙江海洋学院。学校享有以任何方式发表、复制、公开阅 览、借阅以及申请专利等权利。本人离校后发表或使用学位论文 或与该论文直接相关的学术论文或成果时，署名单位仍然为浙江 海洋学院。 学位论文作者签名： 指导教师签名： 日期： 年 月 日 日期： 年 月 日 《中国博士学位论文全文数据库》和 《中国优秀硕士学位论文全文数据库》投稿声明 研究生处： 本人同意《中国博士学位论文全文数据库》和《中国优秀硕 士学位论文全文数据库》出版章程的内容，愿意将本人的学位论 文委托研究生处向中国学术期刊（光盘版）电子杂志社的《中国 博士学位论文全文数据库》和《中国优秀硕士学位论文全文数据 库》投稿，希望《中国博士学位论文全文数据库》和《中国优秀 硕士学位论文全文数据库》给予出版，并同意在《中国优秀博硕 士学位论文全文数据库》和《中国优秀硕士学位论文全文数据库》 以及 CNKI 系列数据库中使用，同意按章程规定享受相关权益。 论文级别： ■硕士 □博士 学位论文作者签名： 指导教师签名： 日期： 年 月 日 日期： 年 月 日 作者联系地址（邮编）： 作者联系电话： 摘 摘 要 摘 要 黄鲫（Setipinna taty），俗名麻口前、毛口国、黄鰶、鸡毛鳓，隶属于脊索动 物 门 ， 硬 骨 鱼 纲 ， 鲱 形 目 （ Clupeiformes ），鳀科 （ Engraulidae ）， 黄鲫属 （Setipinna）；常栖息于淤泥底质、水流较缓的海区，白天栖息的水层较深，夜 晚上浮表层；主要分布于印度洋、太平洋西部，在我国的主要分布海域为东海、 黄海、渤海。 黄鲫是东海区春冬季海洋渔业的主要捕捞对象，其渔获量及比例不可忽视， 随着捕捞强度的增大，不少地区开始重视对黄鲫渔业资源的开发利用,为了准确 评估黄鲫的种质资源现状，我们需要对黄鲫的种质资源进行具体调查和分析。 本研究开发了 11 个黄鲫特异的多态性微卫星标记，根据已经开发的微卫星 标记分析黄鲫遗传结构及遗传多样性水平。我们还获得黄鲫线粒体基因组全序 列，解析其线粒体基因组中编码序列和非编码序列的结构和特征；基于黄鲫和鲱 形目下的 12 种鱼类的线粒体基因组全长，构建鲱形目鱼类的分子系统发育树。 这些研究为黄鲫的种质资源评估，分子辅助育种等研究提供了候选标记。 本研究主要结果如下： 1. 微卫星标记的开发和多态筛选：本研究利用 FIASCO 法构建（CA）13 黄 鲫微卫星 DNA 富集文库，克隆测序，获得 38 个含有微卫星位点的序列，设计 38 对引物，经过筛选优化获得 11 个具有黄鲫特异的多态性的微卫星标记。为黄 鲫的种质资源评估、分子辅助育种等研究提供了候选标记。 2. 群体遗传多样性及遗传结构的分析：利用黄鲫 11 个多态性微卫星标记分 析东海海域舟山、象山、宁海，及黄海海域烟台、威海这 5 个群体的遗传结构及 遗传多样性水平。结果显示，11 个多态位点平均等位基因为 4.84，观测杂合度 和期望杂合度分别在 0.3500~0.8421 和 0.5244~0.6244 之间，表明 11 个微卫星位 点具有较高的杂合度，群体保持着丰富的遗传多样性。烟台和舟山两个群体的亲 缘关系最远；烟台和威海两个群体的亲缘关系最近。 3. 线粒体基因结构和排列顺序的分析：黄鲫线粒体基因组全序列在基因排 列顺序、内部结构等，均类似于其他已经报道过的硬骨鱼类线粒体基因组结构， 且与脊椎动物线粒体的典型模式相吻合。黄鲫线粒体基因组 DNA 全长为 16887bp (登录号 KC439458)，一共包含了 37 个编码蛋白基因，转运 RNA 基因(tRNA)为 I II II 22 个，蛋白质编码基因为 13 个、核糖体 RNA 基因(rRNA)2 个，以及两个没有 参与编码蛋白反应的区域，轻链复制起始区（L-strand）和控制区（Dloop，CR）。 关键词：黄鲫；FIASCO；遗传多样性；微卫星标记；线粒体 AB ABSTRACT PAGE PAGE VI A