链霉菌图像采集与处理系统的开发-生物医学工程专业论文.docxVIP

i‘Nanjing i‘ Nanjing University ofAeronautics and Astronautics The Graduate School College of Automation Engineering Development of Streptomyces Image Acquisition and Processing System AThesis in Biomedical Engineering by Wang Hua Advised by Associate Professor Chen Chunxiao Submitted in Partial Fulfillment of the Requirements for the Degree of Master of Engineering January,2010 . . 啕 本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师指导下，独立进 本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师指导下，独立进 行研究工作所取得的成果。尽我所知，除文中已经注明引用的内容外， 本学位论文的研究成果不包含任何他人享有著作权的内容。对本论文所 涉及的研究工作做出贡献的其他个人和集体，均已在文中以明确方式标 明。 本人授权南京航空航天大学可以有权保留送交论文的复印件，允许 论文被查阅和借阅，可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库 进行检索，可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文。 (保密的学位论文在解密后适用本承诺书) 作者签名： 至车 日 期： 兰竺丝：圣：丑 舻 ∥。．飞·＼7 ‘ 目前已成为国内肝脏及肾 目前已成为国内肝脏及肾 国等国家占领，开发具有 自主知识产权且能转化为生产力的他克莫司生产技术迫在眉睫。而他克莫司为链霉菌的次生代 谢产物，研究链霉菌中他克莫司的代谢网络，解析关键酶及关键代谢途径，提高他克莫司的产 率是关键部分。因此，开发链霉菌图像采集与处理系统，再现链霉菌的生长和代谢过程，对链 霉菌生长条件进行优化，提高目标产物率，尤为重要。 链霉菌图像采集与处理系统的开发包括链霉菌图像采集模块和链霉菌图像处理模块。本论 文重点研究了链霉菌图像处理模块，包括系统硬件平台的设计和系统软件的实现两部分。硬件 设计方面，充分利用基于TMs320DM6446芯片的达芬奇开发极强大的视频图像处理能力和丰 富的外设接口，构造了体积小、处理速度快、控制灵活的链霉菌图像处理系统硬件平台。软件 实现方面，分为达芬奇系统软件和用户软件两部分。重点研究了达芬奇系统软件结构、达芬奇 软件框架Codee Engine以及基于达芬奇平台的应用程序的开发流程，并基于Codec Engine的编 程框架实现了链霉菌图像预处理、水平集分割、链霉菌面积测算功能以及GPIO字符设备驱动 程序开发。实验数据统计分析结果表明，该系统通过链霉菌面积测算，可建立链霉菌面积与其 干重的线性关系，从而链霉菌面积可以作为判断链霉菌生长状况的重要特征参数之一，分析菌 体生长与代谢网络，为实现在线检测与监控，优化链霉菌生长条件，实现目标产物的高效表达 打下基础。所设计的基于达芬奇技术的链霉菌图像采集与处理系统具有良好的准确性、高效性 和稳定性。 关键词：达芬奇技术，Codec Engine，链霉菌，水平集方法，图像处理 链霉菌图像采集与处理系统的开发 链霉菌图像采集与处理系统的开发 ABSTRACT Tacrolimus(FK．506)is important macrolide immune agents，which has become the first-line drugs in clinical of the liver and kidney transplant rejection by now．However,most of the domestic markets have been occupied by Japan，the United States and other countries．It is necessary for to develop productive technology of tacrolimus with independent intellectual property rights and being turned into productive forces．Because the tacrolimus is the secondary metabolites of streptomyces， the key part is to study the metabolism network of tacrolimus in streptomyce