利用DH群体构建中国大白菜AFLP遗传连锁图谱-果树学专业论文.docxVIP

利用DH群体构建中国大白菜AFLP遗传连锁图谱摘要 利用DH群体构建中国大白菜AFLP遗传连锁图谱 摘要 本研究以熟性、耐热性、抗病性和抽薹性等重要农艺性状有明显差异的大白 菜品种汴早．26和光90E16为双亲，以其杂交后代进行游离小孢子培养所得的包 括59个单株的DH群体为试材，构建了AFLP遗传连锁图谱。获得的主要结果 如下： 1、提取大白菜总基因组DNA以改良CTAB法为宜。本研究所提取DNA主 带清楚，无降解现象．浓度在40—60n∥gl之间。样品间浓度均一，分子量在50 kb 左右，可与^DNA相比较。预扩增反应结果显示DNA呈均匀的弥散状．片段大 小为100～500bD。说明本研究所提取DNA质量较好。 2、利用双亲对E+3／M+3进行引物筛选，共获得多态性较好的引物组合83 对，产生多态性条带482条，平均5．8条，引物组合。应用其中的62对引物组合 对DH群体进行AFLP标记分析，共获得426个AFLP多念性标记，平均6．9个／ 日I物组合。在426个AFLP标记中，有125个标记来自母本汴早26，110个标记 来自光90E16，两者比例接近1：l，其中40个标记表现为批显性遗传。 3、对426个AFLP标记进行f检验，在p0．05的条件下，有210个标记发 生偏分离，傧分离比例为49，3％，其中有127个标记来自母本汴早一26，83个标 记来自父本光90E16。 4、运用JoinMap3．0软件对426个标记进行连锁分析，得到一张包括十大主 要连锁群的遗传图谱，、该图谱包括346个AFLP标记，覆盖基因组长度708cM， 平均图距为2．0 cM。连锁群长度集中在39~105 eM之间，连锁群上标记数为9～87 个，平均图距为1．2~4．3 cM。连锁群中包含152个偏分离标记，所占比例为 35．68％。统计偏分离标记在连锁群中的分布，发现了6个偏分离热点，偏分离标 记在热点区域内多以标记簇形式分布。 5、应用软件GGT对DH群体的59个单株迸行基因型分析，平均每个单株 染色体来自母本的频率为50，09％，来自父本的频率为45，92％，两者比例相近， 该DH群体未发生严重的偏分离。 关键词：大白菜；DH群体：AFLP标记技术；遗传图谱 A A Genetic Linkage Map of Chinese Cabbage Based AFLP Markers Using Double-Haploid(DH)Population Zhang Xiaofen (College UniversityYaan，Sichuan China) Abstract A genetic linkage map of Brassica rapa was constructed with AFLP(amplified fragment length polymorphism)markers using F1一derived doubled—haploid(DH) population of 59 lines．This mapping population was developed by crossing low self-compatibility(SC)variety Bianzao一26 and hiigh SC line Guan990E16 which were different from each other distinctly in maturity,heat tolerance，disease resistance， bolting，et a1．The results were follows． 1．A modified CTAB was developed to isolate DNA of Chinese cabbage from each line and parents．Main bands of DNA were very clear with degenetation，and the DNA concentration of each line and parents was varying between 40～60ng／ ⅡI．The molecular weight ofDNA was about 50Kb．which was consistent with九DNA． The of DNA after preamplification isolated in 1％agrose presented very clear smears with the size between 100～600bp．The qutity of DNA extracted in the study was adequa