利用SSR标记定位东乡野生稻苗期耐冷性基因-作物遗传育种专业论文.docxVIP

缩略语RFLP 缩略语 RFLP 限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism) PCR 聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction) STS 序列标记位点(Sequence-Tagged Sites) DAF DNA扩增指纹(DNA Amplification Fingerprinting) RAPD 随机扩增多态性DNA(Randomly Amplified Polymorphic DNA) ALP 扩增子长度多态。l生(Amplicom Length Polymorphism) AFLP 扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism) SAP 特异扩增子多态。l生(Specific Amplicom Polymorphism) SSLP 简单序列长度多态性(Simple Sequence Length Polymorphism) SSCP 单链构象多态性(single Strand ConformationPolymorphism) RGA 抗性基因同源序列(Resistance Gene Analog) SCAR 序列特异性扩增区(Sequence-Characterized Amplified Region) cDNA 互补DNA(Complementary DNA) SSR 简单序列重复(Simple Sequence Repels) QTL 数量性状位点(Quantitative Trait Locus) CAPS 酶切扩增序列多态性(Cleaved Amplified Polymorphic Sequence) RIL 重组自交系(Recombinant Inbred Lines) DH 加倍单倍体(Doubled Haploids) BClFl 回交一代群体(Back Cross Ft) NIL 近等基因系(Near-Isogenic Lines) MAS 标记辅助选择(Marker．Assisted Selection) DY 东乡野生稻(DongXiang Wild Rice) XB 协青早B(XieQingZao B) 硕士学位论文：利用SSR标记定位东乡野生稻苗期耐冷性基因摘 硕士学位论文：利用SSR标记定位东乡野生稻苗期耐冷性基因 摘 要 低温冷(寒)害不仅在北方是威胁水稻生产的大敌，而且在南方也严 重影响着早稻育苗与晚稻的抽穗扬花及灌浆，是我国长江中下游地区水稻 生产的主要限制性因素之一。我国每年因低温损失30～50亿kg稻谷。为 此，利用现代分子生物学技术对水稻耐冷基因进行标记、定位，研究其耐 冷性的遗传规律，对水稻耐冷育种有重大的理论和实践价值。目前水稻耐 冷基因的分子标记和定位研究很少，且主要集中于粳稻耐冷基因源的耐冷 基因定位，而对野生稻耐冷基因的定位研究至今未见报道。 东乡野生稻是世界分布最北(28。14’N)的普通野生稻。它蕴藏着丰 富的抗病虫及抗各种不良环境的抗性基因，尤其是其耐冷性极强，休眠芽 能忍受极端最低温度一12．8℃。由于东乡野生稻具有丰富的抗逆特性，尤 其是具备其它野生稻和栽培稻所没有的强耐冷性，因此，开展东乡野生稻 耐冷基因的定位研究，弄清其耐冷基因在染色体上的具体位点，既可为耐 冷基因的克隆提供素材，又能把与耐冷性密切相连锁的分子标记提供于分 子标记辅助选择育种，以提高水稻耐冷性育种效率，具有重要意义。本研 究采用SSR分子标记技术，应用协青早B／东乡野生稻BC。F。群体的219个 株系，结合人工气候箱稳定的空间条件．采用营养液培养，于1叶l心期 进行耐冷鉴定，以苗期的死苗率作为衡量亲本及各BC．F．群体株系苗期耐 冷性的指标，并将其作为数量性状进行基因定位。研究结果表明： 1，在BC—F，群体中，死苗率呈连续分布，大部分株系的死苗率低于协青早 B，而高于耐冷亲本东乡野生稻，表明东乡野生稻耐冷性为数量性状。 由多个基因控制。 2，根据前人公布的水稻SSLP图谱，对水稻第卜12染色体上的SSR标记 依次进行扩增，共扩增167对引物。其中143对引物扩增成功，用于 检测双亲间的差异。应用于亲本检测和阳性标记筛选的143对微卫星 引物中，56对引物在冷敏、耐冷DNA池和亲本间检测到差异性，依次 用56对在冷敏、耐冷DNA池和亲本间检测到差异性的标记检测群体。 应用单因素方差分析法分析56个标记的茁期死苗率，并估算有关的遗 传参数。在56个检测到多态性的标记中，有5个标记为阳性标记(第 4染色体上RMl 31、RMl27、RM280和第8染色体上RM337、RMl 52)，分 别在第4、8染色体上检测到了一个可能与耐冷性有关的QTL。 关键词