序列比对生物信息学进展实验课3.ppt

/angus/tutorials-2012/bwa_tutorial.html * 生物信息学进展 （3）序列比对 测序数据分析流程 * 1.数据预处理 数据文件 FastQ文件 mapping file 原始数据 FastQ文件 2.序列比对 初步结果 3.数据分析 进一步的结果 4. GO analysis ChIP-Seq RNA-Seq ChIA-PET 。。。 序列比对问题 将测序数据比对到参考基因组 最早的序列比对，是两个基因序列之间的比对 * 原始数据 – FastQ文件 FastQ文件 1. A line starting with @ containing the sequence identifier 2. real sequence 3. a line starting with + after which the sequence identifier is optional 4. encodes the quality values for the sequence in Line 2, and must contain the same number of symbols as letters in the sequence * 以ChIP-Seq数据为例 下载ChIP-Seq数据 [bio2014@node8 Arabidopsis_t