教案第11章生物芯片.docVIP

长 沙 医 学 院 教 案 课程名称 生物信息学 授课题目（章节或主题） 第11章 生物芯片 授课教师 唐亮 所属系（部） 基础系 所属教研室 生技教研室 职称 助教 授课时间 年 月 日第 周星期 第 节第 次课 授课时数 2学时 授课班级 生物技术专业（本科√ 专科□） 2010 级 1 班 教学课型 理论课√ 实验课□ 见习课□ 习题课□ 讨论课□ 其它□ 教材名称、作者、出版社及出版时间 生物信息学概论，罗静初等译，北京大学出版社 教学目的要求： 对生物芯片作了简要介绍，从生物芯片的分类、基本原理几个角度学习生物芯片有关的基本知识 重点与难点： 重点：芯片基本原理 难点：芯片操作技术 教学方法（请打√选择）： 讲授法√ 讨论法□ 启发式□ 自学辅导法□ 练习法(习题或操作) 读书指导法□ ＰＢＬ（以问题为中心的教学法）□ 其他□ 教学手段（请打√选择）： 板书√ 实物□ 标本□ 挂图□ 模型□ 投影□ 幻灯□ 录像□ CAI（计算机辅助教学）√ 教学过程设计和教学内容： 生物芯片(Biochip) 又称微阵列(microarray)。 这一名词是20世纪80年代初提出来的， 把有机功能分子或生物活性分子进行组装，构建微功能单元，实现信息的获取、储存、处理和传输功能。真正的生物芯片出现于20世纪90年代，DNA微阵列技术自1995年诞生之时，就被预言为具有划时代意义的技术，将从根本上改变生物科技的面貌。 生物芯片将生命科学研究中所涉及的不连续的分析过程（如样品制备、化学反应和分析测试），利用微电子、微机械、化学、物理技术、计算机技术在固体芯片表面构建的微流体分析单元和系统，使之集成化、微型化。 生物芯片主要是指采用光导原位合成或微量点样等技术，将大量生物分子如核酸片断、多肽片断、组织切片、细胞等有序地固定于支持物（如玻片、硅片、聚丙烯酰胺、尼龙膜等）的表面，组成密集、有序的二维分子阵列，然后与已标记的待测生物样品中靶分子杂交，通过特定的仪器如激光共聚焦扫描或电荷偶联摄像机（CCD）对杂交信号的强度进行快速、并行、高效的检测分析，从而判断样品中靶分子的数量。 微阵列的主要应用在于对基因表达问题的研究，特别是从全基因组水平定量或定性检测转录产物mRNA。 通过对该数据矩阵的分析，可以回答一系列的生物学问题：基因的功能是什么？在不同条件或不同细胞类型中，哪些基因的表达存在差异？在特定条件下，哪些基因的表达发生了显著变化，这些基因受到哪些基因的调节，或控制哪些基因的表达？ 微阵列广泛应用的另一个重要原因是为了理解基因网络（network）或通路（pathway）。微阵列可以在单一芯片上同时监测整个基因组的变化，因而可以同时理解成千上万个基因之间的相互作用，对整个表达谱有一全面理解。 生物芯片会对21世纪的生命科学和医学的发展产生巨大的影响，可以大大促进后基因组计划的各项研究。通过比较不同个体或物种之间以及同一个体在不同生长发育阶段，正常和疾病状态下基因转录及其表达的差异，寻找和发现新基因，研究它们在生物体发育、遗传、进化等过程中的功能。生物芯片还将在研究人类重大疾病如癌症、心血管病等相关基因及其相互作用机理方面发挥重要作用。在预防医学方面，生物芯片可以使人们尽早认识自身潜在的疾病，并实施有效的防治 生物芯片的分类 1、根据支持介质划分 2、根据制备方法划分 3、根据芯片上固定的探针划分 几种常见的生物芯片 1、基因芯片 基因芯片称DNA芯片（DNA Chip）或DNA微阵列（DNA microarray）。 基因芯片这一技术方法是1991年首次提出的，该技术将成千上万的探针同时固定于支持物上，所以一次可以对大量的DNA分子或RNA分子进行检测分析，从而解决了传统核酸印迹杂交等技术复杂、自动化程度低、检测目的分子数量少、低通量等不足。而且，通过设计不同的探针阵列（array），还可以用于序列分析，称为杂交测序（SBH）。 基因芯片以其无可比拟的信息量、高通量、快速、准确的分析基因的能力，在基因功能研究、基因诊断及药物筛选等方面显示了巨大的威力，被称为是基因功能研究领域的最伟大发明之一。 基因芯片以其高通量、并行检测等特点适应了分析人类基因组计划对海量生物信息提取、分析的需要。深入研究基因突变和基因表达的有效方法的需求是基因芯片发展的动力。由于基因芯片高速度、高通量、集约化和低成本的特点，诞生以后就受到科学界的广泛关注。 2、蛋白质芯片 蛋白质芯片，又称蛋白质微阵列（protein microarray）是指固定于支持介质上的蛋白质构成的微阵列，是在一个基因芯片大小的载体上，按使用目