核酸化学更新版.ppt

A型DNA B型DNA 核酸中核苷酸相继以磷酸二酯键共价连接，一个核苷酸的5’羟基与另一个核苷酸的3’羟基形成磷酸二酯键。核酸的共价主链由磷酸及戊糖残基构成，含氮碱基可以看成是连接到主链上固定间隔的侧链基团。DNA和RNA的骨架结构是亲水的，糖残基的羟基与水形成氢键，磷酸基团的pKa接近于零，pH7时完全离子化并带负电，所带负电荷通常与带正电的蛋白质、金属离子及多胺发生离子作用被中和。 pA-C-G-T-AOH pApCpGpTpA pACGTA Watson和Crick定义的核酸中碱基对的氢键模式 DNA中的四种碱基及它们间的氢键 胞嘧啶 胸腺嘧啶 鸟嘌呤 腺嘌呤 T C A G 碱基间的氢键可以有不同形式 Watson-Crick Hoogsteen 碱基配对时 碱基一般以酮式存在，而不是醇烯式； 碱基中的H原子一般不移动，因此很少有亚氨基团； 在中性pH条件下，参与氢键的-NH2基均不带电荷，这是杂环电子共轭以及氢键的共同作用的结果，否则双螺旋结构不会稳定。 （约1 %） Watson-Crick的DNA双螺旋 2.0 nm 结构特征 双螺旋分子中糖分子与纵轴平行，与碱基平面垂直 稳定双螺旋结构的作用力为氢键和碱基堆积力（即疏水作用） 碱基的配对使得双螺旋DNA分子在复制时以半保留的形式进行。 DNA双螺旋分子的钠盐结晶结构一共发现了三种，分别 命名为A、B和C型。其中B型与Watson-Crick提出的模型一致，A和C型在低相低湿度的条件下形成，它们的螺距都比B型要短。Z型DNA首先在富含GC的DNA短片段中发现，后用抗体证明天然DNA中也有，它是一种左旋螺旋，在细胞中可能起着帮助解链和调控基因表达的作用。 螺距 残基数 碱基倾斜 A型(75%,Na) 2.8 11 20° B型(92%,Na) 3.4 10.5 0° C型(66%,Li) 3.1 9.3 6° Z型 4.6 12 9° B DNA Z DNA 在相对湿度为75%以下所获得的DNA纤维的X-光衍射分析结果，与B-DNA不同，A-DNA也由反向的两条链组成双螺旋-右手螺旋，但螺旋体较宽而短，碱基对与中心轴倾角为190。 Rich在研究CGCGCG寡聚体时发现了Z-DNA，为左手螺旋-左旋DNA，因为磷酸基在多核苷酸骨架上的分布呈Z字形而得名，只有一条大沟，没有小沟。 B-DNA的局部区域可出现Z-DNA。 三种形式DNA的比较 核酸的结构层次 核酸的一级结构： 碱基的排列顺序 DNA 5- ATGCATGC……3 3- TACGTACG……5 RNA 5- AUGCAUGC……3 核酸的二级结构： 形成双螺旋的部分 核酸的三级结构： 空间构象 Messelson 和 Stahl 的实验 大肠杆菌DNA的复制 电镜照片 同位素标记（红色） * * * 名称与缩写(2) Ribonucleoside (Ns) 核糖核苷 （不带磷酸） adenosine (Ado) 腺(嘌呤核)苷 guanosine (Guo) 鸟(嘌呤核)苷 cytidine (Cyd) 胞(嘧啶核)苷 thymidine (Thd) 胸(腺嘧啶脱氧核)苷 uridine (Urd) 尿(嘧啶核)苷 Ribonucleotide (Nt) 核糖核苷酸 （带磷酸） adenosine 5’- mono (di, tri) phosphaste； AMP, ADP, ATP deoxyribonucleoside 脱氧核糖核苷（不带磷酸） deoxyadenosine (dAdo) …… deoxyribonucleotide 脱氧核糖核苷酸（带磷酸） dAMP, dADP, dATP……dNTP DNA中的四种碱基及它们间的氢键 胞嘧啶 胸腺嘧啶 鸟嘌呤 腺嘌呤 T C A G －CH3 Ura与DNA分子中的Thy的区别 RNA分子中的四个碱基 2、核苷的解离 戊糖可增