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基于IRAP技术的‘磨盘柿’变异单株鉴定_亲缘关系
论文导读::君迁子作为与柿的亲缘关系较近。许多主栽柿品种来自芽变[8]。本试验通过逆转座子分子标记技术。由UPGMA聚类所得的树状图(图2)可见。
论文关键词:品种鉴定,亲缘关系,芽变,逆转座子分子标记,UPGMA
植物基因组40%-60%为逆转座子,其在纵向和横向传递中能产生高度的异质性和拷贝数,且易被生物和非生物因素差异激活,成为植物遗传多样性的重要来源。基于逆转座子的分子标记是检测基因组变异的手段之一亲缘关系,尤其是Kalendar等[1]开发的逆转座子间扩增多态性(inter-retrotransposon amplified polymorphism,IRAP)技术,操作简单、多态性丰富、检测效率高,已在种质鉴定[2, 3, 4, 5]、遗传多样性检测和系统发育重建[6]、基因作图以及重要农艺性状基因的标记[7]等方面得到成功应用。
芽变是多年生木本果树植物新品种选育的重要变异来源,许多主栽柿品种来自芽变[8]。磨盘柿原产我国,分布最广、面积最大,长期的营养繁殖可能已经积累许多变异类型,但早期采用的形态学鉴定由于环境条件和技术人员的主观因素等原因往往影响鉴定结果的真实性。常规分子标记一般难以准确鉴定芽变单株[9, 10, 11]站大全。基于逆转座子的分子标记技术可能对变异微小的单株鉴别更为有效[2, 12, 13]。因此亲缘关系,本研究对来自北京市房山区磨盘柿产区的系列变异单株进行IRAP分析,以期为明晰其变异性质提供科学依据。
表1 本研究所用20份试材
Table 1 List of 20 Diospyros spp. used in this study
编号
Code
基因型
Genotype
学名
Scientific name
来源地
Origin
样品采集地
Collection location
备注
Note
1
BZDMP
Diospyros kaki Thunb.
China
a
磨盘柿标准品
Standard Damopan
2
DMP2
D. kaki Thunb.
China
b
磨盘柿芽变
Mutation from Damopan
3
DMP3
D. kaki Thunb.
China
b
磨盘柿芽变
Mutation from Damopan
4
DMP4
D. kaki Thunb.
China
b
磨盘柿芽变
Mutation from Damopan
5
DMP5
D. kaki Thunb.
China
b
磨盘柿芽变
Mutation from Damopan
6
DMP6
D. kaki Thunb.
China
b
磨盘柿芽变
Mutation from Damopan
7
DMP7
D. kaki Thunb.
China
b
磨盘柿芽变
Mutation from Damopan
8
DMP8
D. kaki Thunb.
China
b
磨盘柿芽变
Mutation from Damopan
9
DMP9
D. kaki Thunb.
China
b
磨盘柿芽变
Mutation from Damopan
10
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