测序样品要求及注意事项-北京大学系统生物医学研究所.PDF

测序样品要求及注意事项 系统生物医学研究所面向校内外提供Illumina HiSeq 1000 测序平台的高通 量测序服务。为保证测序结果，请仔细阅读样品要求及注意事项，提交符合要求 的样品，并附填写完整的《样品信息单》。 1. 样品量 测序平台接受的样品类型包括提取好的基因组DNA 、Total RNA、ChIP-Seq 产物等。不同样品所需的样品总量和样品浓度如下表所示： 测序类型 样品总量 样品浓度 全基因组测序 10 μg 200 ng/μl 外显子测序 10 μg 100 ng/μl 转录组RNA 测序 10 μg 200 ng/μl 链特异RNA 测序 10 μg 200 ng/μl Small RNA 测序 10 μg 1000 ng/μl ChIP 测序 20 ng 5 ng/μl 注：样品总量和样品浓度均以Qubit 检测结果为准。 2. 样品要求 提交的样品要求OD260/OD280 大于1.8。基因组DNA 要求主带清晰完整、无 降解，无蛋白质或RNA 污染。Total RNA 要求完整性好，18S、28S 条带明亮、 清晰。ChIP-Seq 产物要求DNA 片段在100 bp-500 bp 之间，主峰在200 bp-300 bp 之间。 3. 样品保存 请尽量提供新鲜制备的样品，样品溶解于TE buffer 或超纯水中，-20℃保存。 DNA 样品保存时间不超过三个月，RNA 样品保存时间不超过一个月。运输过程 中请保持样品的低温状态，避免降解。除提交的样品外，请在实验室保留足够的 样品备份。 4. 测序费用 不同测序项目的费用需根据样品情况和测序类型进行评估，具体请与 mxiangyan@bjmu.edu.cn 联系 。测序平台实行预付款制度，预付款数目为测序总 费用的一半，预付款到位后即开展建库及测序工作。建库完毕测序前需至少支付 80%的费用。 5. 数据结果 数据结果为fastq 格式的reads 数据。对有需求的用户可提供简单的数据分析 如reads 定位等。数据交付客户同时，客户需将剩余款项支付完毕。