生物信息学讲义课件.ppt

Introduction to Bioinformatics 计算机科学 生物学 物理 数学 信息科学 生物信息学 各学科参与、协作：生命科学、数学、物理学、化学、计算机 科学、材料科学以及伦理、法律等社会科学 Introduction to Bioinformatics 首要的科学问题 DNA芯片的问题 结构生物学 如何找到记载在基因组DNA一维 结构上控制生命时间、空间的调 控信息的编码方式和调节规律。 应用数学、复杂系统理论、信 息论、非线性科学…… 催生?生物信息学、计算生物学 交叉性技术领域：物理学、 微电子信息技术、生化技 术、信息技术…… 前沿领域之一：生物物理学、 生物化学、晶体学、波谱学、 光谱学以及X射线晶体衍射技 术、核磁共振技术…… Introduction to Bioinformatics 基因组时代 功能基因时代 …后基因的时代的到来 投资计划书简介 功能基因组的任务 　 进行基因组功能注释 　　认识基因与疾病的关系 　　 掌握基因的产物及其在生命活动中的作用 功能基因组学的研究内容 注释所有基因产物的功能，这是目前基因组功能注释的主要层次 研究基因的表达调控机制，研究基因在生物体代谢途径中的地位，分析基因、基因产物之间的相互作用关系，绘制基因调控网络图 进一步识别基因，识别基因转录调控信息，分析遗传语言 4 3 1 2 比较基因组学研究，在基因组水平对各个生物进行对照比较，可以揭示生命的起源和进化、发现蛋白质功能 Introduction to Bioinformatics 人类基因组与其它生物基因组比较 Introduction to Bioinformatics 例：人与鼠染色体的差别 Introduction to Bioinformatics Structure Function Pathways Physiology Populations Evolution Ecosystems Genomes Gene Products 后基因组时代 Introduction to Bioinformatics 数据处理和 关联分析 发现药物 作用对象 确定靶目标 分子 针对靶目标进行合理的药物设计 未来的药物研究过程将是基于生物信息知识挖掘的过程 Introduction to Bioinformatics 基因组计划 产生的基因 及基因多态 性数据与临 床医学检验 结果之间的 关系需要利 用生物信息 学的方法去 分析、去揭 示 根据这样的分析结果，科学家能够更准确地了解疾病产的根本原因，更精确地预测某个人患癌症、糖尿病或者心脏病的可能性，从而彻底改变我们诊断、治疗和预防疾病的方式 生物信息学与疾病检测 Introduction to Bioinformatics 蛋白质结构与功能关系的研究 蛋白质结构 蛋白质序列 蛋白质功能关系 Introduction to Bioinformatics 基于生物信息学的新药设计 Introduction to Bioinformatics 生物信息学 研究蛋白质结构及功能关系 研究蛋白质的进化问题， 研究不同蛋白质之间的进化关系 研究蛋白质的性质 ……新的生物学研究模式的出发点应该是理论的。科学家将从理论推测出发，然后再返回到实验中去，追踪或验证这些理论假设。……生物学家不仅必须成为计算机学者，而且也要改变他们研究生命现象的途径。 ——W. Gilbert, Towards A Paradigm Shift in Biology, Nature, 349(1991)99 现代生物学的发展 高通量数据获取日益 实现自动化、半工业化 海量数据 更复杂层次的生物学问题 生物学 Introduction to Bioinformatics 21世纪生命科学 理论 计算 实验 数学与物理科学 生物信息学 1、从人类基因组计划（HGP）说起 Introduction to Bioinformatics Introduction to Bioinformatics 60年代初，美国总统Kennedy提出两个科学计划： ?登月计划 ?攻克肿瘤计划 ? 人类遗传信息的复杂性 人类基因组计划 (HGP，Human Genome Project) 目标：整体上破解人类遗传信息的奥秘 Introduction to Bioinformatics 生命活动三要素：物质、能量、信息 Introduction to Bioinformatics DNA 基因 基因组 具有遗传效应的DNA 分子片段 遗传物质