利用SSR标记研究几个玉米改良系的类群划分.docVIP

利用SSR标记研究几个玉米改良系的类群划分.doc

  1. 1、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。。
  2. 2、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载
  3. 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
  4. 4、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
  5. 5、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们
  6. 6、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
  7. 7、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
PAGE PAGE 1 利用SSR标记研究几个玉米改良系的类群划分   摘要:利用SSR标记从分子水平上对来源于先玉335杂交种、6WC×郑58和PH6WC×郑58×E003基础群的4个改良系以及13个国内骨干自交系,进行遗传关系类群划分。UPGMA聚类分析结果表明,17个自交系可划分4类群,第Ⅰ类群为Reid群,改良系J1207、J1401、8W131、J2067均属于Reid群,B73、6WC、掖478亦属此群;第Ⅱ类群包括两个亚群:丹340、8F1658属旅大红骨亚群,齐319、J666属PN亚群;第Ⅲ类群是No-Reid群,包括Mo17、B1M、4CV;第Ⅳ类群是塘四平头群,包括黄早四、昌7-2。   关键词:玉米;改良系;SSR标记;聚类分析   中图分类号:S513文献标识码:A文章编号:1674-0432(2013)-08-17-2   基金项目:吉林省科技发展计划项目   玉米育种主要利用杂种优势,玉米杂种优势群的准确划分和杂种优势模式的合理确立,是选育优良组合的前提[1]。通过种质扩增、改良和创新选育出的新自交系[2],要进一步利用,就必须进行种质类群的划分。育种者对杂种优势类群和杂优模式采用多种方法进行过系统研究[3],其中SSR标记技术是一种较为简单快捷的方法[4]。   本试验利用SSR分子标记技术对4个改良系(是对国外种质与国内种质在本地生态环境下的种质改良选育出的,其中J1207、J1401来自先玉335杂交种,8W131来自6WC×郑58基础群,J2067来自PH6WC×郑58×E003基础群)及13个国内骨干自交系进行遗传分析,估算遗传距离,划分杂种优势类群、预测杂种优势的可行性,为分子标记辅助育种提供理论依据,指导如何利用外引玉米材料选育改良优良自交系,组配强优势组合。   1材料与方法   1.1试验材料   试验选用的17份玉米自交系材料,其名称、来源及编号见表1。   1.2实验方法   1.2.1基因组DNA提取   玉米材料基因组DNA提取参照Rogers的CTAB提取法[5]。用紫外分光光度仪根据OD值测定DNA浓度,把DNA浓度统一调至10ng/L备用。   1.2.2SSR分析   SSR引物是选用分布于玉米10对染色体上的20对SSR引物,由上海生工合成。PCR总反应体系为20ul,包括说上下游引物各0.125ul,10×Buffer(含Mg2+)2ul,Tag酶0.2ul,4种dNTP共1.2ul,DNA模板2ul,不足部分由ddH2O补充。热循环反应过程包括:94℃模板DNA预变2min,1个循环;94℃模板DNA变性30sec,58℃引物与模板靶位点结合1min,72℃引物沿模板延伸1min,共35个循环;最后在72℃延伸5min,4℃保存。PCR扩增产物用6%变性聚丙烯酰胺凝胶在1×TBE缓冲液中电泳,80W恒功率2h,银染检测。   1.3数据统计分析   根据SSR扩增结果,在相同迁移位置有带记为1,无带记为0,缺失记为9,建立数据库。聚类距离按Nei和Li的方法[6],计算自交系间的遗传相似系数(GS)和遗传距离(GD)。利用DPS统计软件[7],采用类平均法(UPGMA)进行聚类分析,构建树状图。   2结果与分析   2.117份玉米自交系SSR标记遗传距离分析   20对SSR引物在17份米自交系间进行SSR检测,一共有16对引物扩增出了产物,扩增效果良好,如图1、图2。16对引物共检测出67个等位基因变异,每对引物检均能测出3~6个等位基因,平均为4.19个。根据SSR扩增结果得出的数据,计算17份玉米自交系间的遗传距离,遗传距离变化范围为0.196~0.747,平均值为0.69。其中,遗传距离最小的是郑58与改良系8W131,仅为0.196;其次为改良系J1207与6WC,遗传距离是0.235;第三为改良系J2067与郑58,遗传距离是0.298,第四为改良系J1401与6WC,遗传距离是0.301。   2.217份玉米自交系聚类分析   根据遗传距离矩阵,应用类平均法(UPGMA)方法,进行聚类分析,得到了17份玉米自交系的聚类分析图(图3)。   根据SSR聚类树形图,可看出,以遗传距离0.70为标准,可将17份玉米自交系划分4大类群:   第Ⅰ类群统称为Reid群,包括8个自交系,可细化为两个亚群:第一个亚群是以B73为代表的Reid群,6WC、J1207、J1401属于这个亚群;第二个亚群是以掖478为代表的改良Reid群,郑58、J2067、8W131属于这个亚群。   第Ⅱ类群有8个自交系,包括两个亚群:丹340、8F1658属于第一个亚群旅大红骨类群,齐319和J666属于第二个亚群PN类群。   第Ⅲ类群是

文档评论(0)

gmomo-lt + 关注
实名认证
文档贡献者

该用户很懒,什么也没介绍

1亿VIP精品文档

相关文档