分子生物学chapter4从mRNA到蛋白质.pptVIP

分子生物学 第四讲 生物信息的传递（下）从mRNA到蛋白质 图4-12 翻译起始复合物的形成(原核） 第一步，30S小亚基与翻译起始因子IF-1，IF-3结合，通过SD序列与mRNA模板相结合。 第二步，fMet-tRNAfMet在IF-2的协同下进入小亚基的P位，tRNA上的反密码子与mRNA上的起始密码子配对。 第三步，带有tRNA、mRNA、三个翻译起始因子的小亚基复合物与50S大亚基结合，释放翻译起始因子。 30S亚基具有专一性的识别和选择mRNA起始位点的性质，IF3协助该亚基完成这种选择。 Shine及Dalgarno等证明几乎所有原核生物mRNA上都有一个5’-AGGAGGU-3’序列，这个富嘌呤区与30S亚基上16S rRNA 3’末端的富嘧啶区5’-GAUCACCUCCUUA-3’相互补。 图4-13 细菌mRNA分子上往往存在一个与16S rRNA3’末端相互补的SD序列。 细菌核糖体上一般存在三个与氨基酰-tRNA结合的位点，即A位点（aminoacyl site），P位点（peptidyl site）和E位点（Exit site）。只有fMet-tRNAfMet能与第一个P位点相结合，其它所有tRNA都必须通过A位点到达P位点，再由E位点离开核糖体。 真核生物蛋白质生物合成的起始基本与原核生物相同，只不过其核糖体较大，有较多的起始因子，mRNA具有m7GpppNp帽子结构，Met-tRNAiMet不甲酰化，mRNA分子5’端的“帽子”和3’端的多聚A都参与形成翻译起始复合物（图4-14）。 图4-14 真核生物翻译起始复合物的形成。 4. 4. 3 肽链的延伸 生成起始复合物，第一个氨基酸（fMet/Met-tRNA）与核糖体结合以后，肽链开始伸长。按照mRNA模板密码子的排列，氨基酸通过新生肽键的方式（图4-15）被有序地结合上去。肽链延伸中的每个循环都包括AA-tRNA与核糖体结合、肽键的生成和移位三步。 图4-15 多肽链上肽键的形成——缩合反应。 1．后续AA-tRNA与核糖体结合 图4-16 细菌中肽链延伸的第一步反应：第二个氨基酰-tRNA的结合。该氨基酰-tRNA首先与EF-Tu · GTP形成复合物，进入核糖体的A位，水解产生GDP并在EF-Ts的作用下释放GDP并使EF-Tu结合另一分子GTP，进入新一轮循环。 由于EF-Tu只能与fMet-tRNA以外的其他AA-tRNA起反应，所以起始tRNA不会被结合到A位上，mRNA内部的AUG不会被起始tRNA读出，肽链中间不会出现甲酰甲硫氨酸。 2．肽键的生成 图4-17 细菌中肽链延伸的第二步反应：肽键的生成。 在核糖体·mRNA·AA-tRNA复合物中，AA-tRNA占据A位，fMet-tRNAfMet占据P位。 在肽基转移酶（peptidyl transferase）的催化下，A位上的AA-tRNA转移到P位，与fMet-tRNAfMet上的氨基酸生成肽键。 起始tRNA在完成使命后离开核糖体P位点，A位点准备接受新的AA-tRNA，开始下一轮合成反应。 3．移位 肽键延伸的最后一步是移位，即核糖体向mRNA 3’端方向移动一个密码子。 图4-18 细菌中肽链延伸的第三步反应：移位。 核糖体通过EF-G介导的GTP水解所提供的能量向mRNA模板3’末端移动一个密码子，使二肽基-tRNA完全进入P位,准备开始新一轮肽链延伸。 大肠杆菌核糖体小亚基由21种蛋白质组成，分别用S1……S21表示，大亚基由36种蛋白质组成，分别用L1……L36表示。 真核生物细胞核糖体蛋白质中，大亚基含有49种蛋白质，小亚基有33种蛋白质，它们的相对分子质量在8×103～4.0×104之间。 图4-9 核糖体结构模型及原核与真核细胞核糖体大小亚基比较。 4. 3. 2 rRNA 1．5S rRNA 细菌5S rRNA含有120个核苷酸（革兰氏阴性菌）或116个核苷酸（革兰氏阳性菌）。 5S rRNA有两个高度保守的区域，其中一个区域含有保守序列CGAAC，这是与tRNA分子TψC环上的GTψCG序列相互作用的部位，是5S rRNA与tRNA相互识别的序列。 另一个区域含有保守序列GCGCCGAAUGGUAGU，与23S rRNA的中一段序列互补，可能是5S rRNA与50S核糖体大亚基相互作用的位点。 2．16S rRNA 长约1 475～1 544个核苷酸之间，含有少量修饰碱基，位于30S小亚基内。 16S rRNA的结构十分保守，其中3’ 端一段ACCUCCUUA的保守序列，与mRNA 5’ 端翻译起始区中的SD序列互补。 16S rRNA靠近3 端处还有一段与23S rRNA互补的序列，在30S与50S亚基