基因组结构和功能.pptVIP

(七)基因常常成簇排列，没有间隔序列或间隔序列很小。功能相关蛋白质基因在基因组的1个或几个特定部位，丛集成簇被转录成多顺反子，然后加工成各种蛋白质的mRNA模板。如腺病毒晚期基因。 (八)不规则的结构基因 1.几个结构基因的编码区不规则，因此有些结构基因无翻译起始序列。 2.有的mRNA（=gene）没有5’帽子，但有翻译增强子。 (九)DNA或RNA 1种病毒基因组只是1种核酸。 三、典型病毒基因组 （一）SV40病毒基因组 SV40（simian sarcom avirus40 猴肉瘤病毒)属乳多空病毒类，是最小的DNA病毒之一。它可长期潜伏于猴肾细胞，对新生仓鼠有致癌性，体外试验还可使多种属细胞恶性转化。 1、基因组结构特点 （1）双链环状DNA分子、MW3×103KD，长52436p,与4种组蛋白（H2A、H2B、H3及H4）综合，与真核染色质区别在于不含H1。 （2）基因组由早期基因、调控区和晚期基因构成。 ①早期基因含有2个重叠基因，编码T和t（T=tumor)抗原 ②晚期基因含3个重叠基因，编码VP1（主），VP2和VP3（次）3种衣壳蛋白 ③调控区位早、晚期基因之间，长约4006p包括复制起点，启动子和增强子，可调节基因组的复制及早、晚期基因的转录。 2、SV40病毒基因的表达 （1）启动子位于调控区复制起点上游，其中含有RNA pdII识别位点位于-21-26bp之间的TATA盒可启动RNA转录起始准确位置，一般不相差10个核苷酸。 （2）增强子 在106-250位是2个串联的含有72bp的完全重复顺序，即为增强子，能增强SV40及异源基因的表达。 （3）早期基因转录的mRNA前体选择剪接形成不同的mRNA（TmRNA、t-mRNA) 3、病毒基因组的复制及基因表达调控 T抗原控制病毒的复制，启动晚期基因转录。 （1）早期基因T及t的表达受T抗原的反馈阻遇，表现一种自我调节作用。 （2）晚期基因表达需要T抗原及SV40DNA本身的复制。 一般过程是，感染早期合成T、t抗原→T-方面抑制早期mRNA进一步合成；另一方激活多种与DNA复制有关的酶，引发病毒的复制→进而推动晚期RNA的合成，产生Vp蛋白（12h)→V-DNA+VP123→病毒颗粒。 （二）HBV基因组 HBV是乙肝的病原体，它可造成持续性感染，引起急、慢性肝炎，部分患者可发生肝硬化，HBV原发性肝癌发生密切相关，我国HBSAg携带者高达10%，因而我国特别重视HBV的研究。 1、HBV基本结构 （1）电镜下观察 ①呈园球形，直径约42nm，称Dane颗粒（以发现者命名）； ②中间含1个致密的内核（core)，直径约27nm； ③外为1层约14nm外壳（capsid)。 （2）①表面有HBsAg（hepatitis B virhs surface antigen)； ②核心有HBcAg和HBeAg； ③含DNA pol、prorein kinase(蛋白激酶）和reverse transcriptase（逆转录酶），后者与病毒复制特点有关。 2、HBV基因组结构 （1） ds(±)DNA组成的环状结构，开环不封闭。侵入细胞后借助胞内DNA修复机制转变成cccDNA分子（共价闭合环状超螺旋）。 （2）基因组双链DNA长短不一，外长内短，长负（链）短正（链），长链2/3是双链，1/3是单链。两链间隙由DNApol填充（上（1）述）。 （3）长链（负链）基因重叠是转录mRNA的模板链. 不同毒株均含有4个开放性阅读框（openreading frame, ORF见第五章)S.C.P.X，其中P区与S.C.X.互相重叠50%以上，故多个ORF可读码2次以上，编码2个以上蛋白质。其中： S区 编码主要蛋白为HBsAg C区 编码HBcAg等。 P区 编码DNApol是依赖RNA的DNApol（逆转录酶）。 X蛋白功能不详。 4、HBV与肝癌的关系 现在普遍认为，HBV感染与原发性肝癌关系密切，流行病学及分子病毒学的证据如下： （1）原发性肝癌（肝细胞性肝癌）HBSAg高达85%，其他肿瘤患者仅为15%； （2）培养肝癌细胞株，不断释放出HBsAg(+)； （3）cDNA 探针检查到HBV已整合到肝癌细胞DNA中去； （4）肝癌病人的癌基因，如Ki-ras、Ha-ras、myc被激活。 （三）脊髓灰质炎病毒基因组（ss(+)RNA) 1、基因组结构特点 （1）ss(+)RNA，MW2.5