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热带亚热带植物学报 2015 ,23(3) :227 ~ 235
Journal of Tropical and Subtropical Botany
-
落地生根S 腺苷高半胱氨酸水解酶基因的克隆及生
物信息学分析
1 1 2 3 4 4 4 4*
苏振声, 苏文锋, 杨秉建, 张利娟, 李亚超, 白宇清, 闫纯, 曾会明 ,
钟天秀4*
(1. 厦门日懋城建园林建设股份有限公司, 福建 厦门 361101; 2. 深圳市日昇园林绿化有限公司, 广东 深圳 518000; 3. 暨南大学深圳旅游学
院, 广东 深圳 518053; 4. 北京林业大学林学院草坪研究所, 北京 100083)
摘要: 为 了解落地生根(Kalanchoe daigremontiana)的 SAHH 基 因功能 ,采用 RACE 技术从其 叶片克隆了 SAHH 的全长 cDNA
序列 ,命名为 。结果表 明, 全长为 1748 bp ,含 1458 bp 完整 的开放 阅读框(ORF) ,推测编码 485 个氨基酸。
KdSAHH KdSAHH
预测落地生根 SAHH 蛋 白分子量约为 53 kDa ,理论等 电点为 5.59~5.682 。Scanprostie 和 DNAstar 预测表 明,落地生根 SAHH
蛋 白在进化上非常保守 ,与苜蓿 的亲缘关 系较近。以黄羽扇豆为模板 ,利用 SWISS-MODLE 和 Phyre 程序模拟 的落地生根
SAHH 蛋 白亚基三维结构有一定差异 。这些为落地生根 KdSAHH 的表达和功能研究奠定 了基础 。
关键词: 落地生根 ;S-腺苷高半胱氨酸水解酶 ; ;克隆 ;生物信息学
SAHH
doi: 10.11926/j .issn.1005–3395.2015.03.001
-
Cloning and Bioinformatics Analysis of S adenosylhomocysteine
Hydrolase Gene form Kalanchoe daigremontiana
1 1 2 3 4 4
SU Zhen-sheng , SU Wen-feng , YANG Bing-jian , ZHANG Li-juan , LI Ya-chao , BAI Yu-qing ,
YAN Chun4, ZENG Hui-ming4*, ZHONG Tian-xiu4*
(1. Xiamen Rimao Landscape Construction Company Limited, Xiamen 361101, China; 2. Shenzhen Risheng Landscape Company Limited, Shenzhen
51800, China; 3. Shenzhen Tourism College of Jinan University, Shenzhen 518053, China; 4. Turfgrass Reasearch Institute, Beijing Forestry
University, Beijing 100083, China)
Abstract: In order to understand the function of SAHH in Kalanchoe daigremontiana, a cDNA sequence, named
as KdSAHH, was cloned by RT-PCR and RACE-PCR. The results showed that the full-length of KdSAHH cDNA
was 1748 bp, encoding 485 am
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