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液相色谱和质谱联用技术结合化学计
液相色谱和质谱联用技术结合化学计量学
应用于代谢组学的研究进展
林艳萍 1 , 2
司端运 2
3 2
刘昌孝
1 (天津大学化工学院制药工程系 , 天津 300072 )
2 (天津药物研究院 ,天津药代动力学与药效动力学省部共建国家重点实验室 ,天津 300193 )
摘 要 代谢组学作为系统生物学的重要组成部分 ,已经成为继基因组学 、转录组学 、蛋白质组学之后兴起的
一个新的组学研究热点 。准确全面的检测生物体液中浓度较低的代谢物变化是进行代谢组学研究的基础 。 液相色谱和质谱联用 (LC /M S)技术结合化学计量学很好地实现了对大量样品和微量代谢物的快速定性 、定 量分析 ,极大地推动了代谢组学的相关研究 。本文综述了 LC /M S与化学计量学相结合用于代谢组学研究的 现状 ,并对后续的研究进行了展望 。
关键词 液相色谱和质谱联用技术 , 化学计量学 , 代谢组学 ,评述
1 引
言
代谢组学 (m e tabonom ic s)是继基因组学 、转录组学 、蛋白质组学之后兴起的一个新的组学研究热
点 ,是系统生物学的重要组成部分 [ 1~3 ] 。N icho lson等 [ 4 ]在 1999 年提出代谢组学的概念 : 对病理生理刺 激或基因改变时生物体系的动态代谢响应所进行的多参数定量分析 ( the quan tita tive m ea su rem en t of the
dynam ic m u ltip a ram e tric m e tabo lic re spon se s of living system s to p a thop hysio logica l stim u li o r gene tic mod ifi2 ca tion) 。体液中的代谢物与细胞 、组织中的代谢物处于动态的平衡当中 。当机体由于外界刺激或毒性 反应导致组织细胞出现异常的时候 ,正常的代谢过程出现障碍 ,生物的体液组成就会产生变化 。代谢组 学的研究目的就是从尿液 、血浆 、血清 、唾液和胆汁等生物体终端样本中检测代谢物 ,或跟踪代谢水平整 体的动态变化 ,提取“组学 ”信息 ,以此来反映生物体在外源刺激作用下的体内生物学过程变化情况 。 其中的一个基础研究过程就是全面准确的对生物体的终端代谢产物进行定性和定量分析 。由于生物体 内的各种代谢物往往以较低的浓度存在于复杂的生物介质中 ,使得有关代谢组学的研究工作进展缓慢 。
随着分析技术的发展 ,近年来对大量样品和微量代谢物的分析技术取得长足进步 ,为代谢组学研究 的具体实施提 供 了 技 术 支 持 。代 谢 组 学 研 究 , 主 要 使 用 的 分 析 方 法 有 核 磁 共 振 波 谱 ( NMR ) 、质 谱 (M S) 、色谱 ( GC或 H PLC ) 、红外光谱 、库仑分析 、紫外吸收 、荧光散射及发射性检测和光散射等 [ 5 ] ,其中 最为常用的方法是核磁共振分析和质谱分析 。
上述分析手段的机制 、特点等各不相同 ,但都会在较短的时间内产生海量的多元性数据 ,需要对其 进行统计和归类分析 ,从中提取特征代谢物或代谢量的整体变化规律 。传统的人工提取信息的方法已 经远远不能满足要求 。近年来 ,研究者们多借助化学计量学原理编辑软件在计算机上实现该过程 。因 此 ,代谢组学研究就与高通量 、高灵敏度的分析手段以及准确 、迅速的信息提取方法实现了紧密地结合 。 许多基因组学 、转录组学 、蛋白质组学等研究无法察觉的变化 ,可以通过分析代谢组体现出来 ,再加上代 谢组学研究还具有无损伤 、可量化的特点以及高通量 、低成本的优势 [ 6 ] ,近年来代谢组学研究在药物研 发 、药物安全性评价 [ 7 , 8 ] ,环境外源物毒性检测 [ 9 ] 、营养分析 [ 10 ] 、疾病诊断 [ 11~13 ]及植物代谢组学 [ 14 ] 等领 域都彰显出巨大的科学潜力 。
2 L C /M S技术的特点
液相色谱和质谱联用技术在有关代谢物的分析研究中发挥着越来越重要的作用 。色谱是最常用的
2006 211 215 收稿 ; 2007 202 228 接受
本文系国家自然科学基金 (No., )资助项目
3 E2m a il: liuchangxiao@163. com
分 析 化 学第 35卷1536
分 析 化 学
第 35卷
1536
分离分析工具 ,与质谱联用则可以更高效 、快速的完成从分离到分析的一整套操作 。气相色谱与质谱联
用 ( GC /M S)技术和 LC /M S技术可以同时检测出数百种化合物 ,包括糖类 、有机酸 、氨基
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