用rapd分子标志方法研究氧化亚铁硫杆菌遗传多样性.docVIP

遗　传HER EDI TA S (Beijing 26(1:69~74,2004 研究报告 收稿日期:2002-11-26;修回日期:2003-03-03 基金项目:国家杰出青年基金助[Supported by the National Foundation of the Outstanding Y outh (No作者简介:贺治国(1978-,男,在读博士,专业:微生物学,从事氧化亚铁硫杆菌的分子遗传学基础研究。 E 2mail :hzg13@163.com ,Tel :0731-******* 通讯作者:胡岳华(1962-,男,教授,博导,专业:矿物加工。E 2mail :hyh @ ,Tel :0731-******* 用RAPD 分子标志方法研究 氧化亚铁硫杆菌遗传多样性 贺治国1,胡岳华1,胡维新2,钟　慧2,徐　兢1,朱　敏2 (1.中南大学资源加工与生物工程学院,长沙410083;2.中南大学湘雅医学院分子生物学研究中心,长沙410078 摘　要:本文对采自7个不同环境的氧化亚铁硫杆菌进行了随机扩增多态性DNA (RAPD 分析,20个引物中筛选出扩增效果较好的4个引物,每个引物能产生1~9条DNA 条带。通过4个引物的RAPD 分析获得的平均相似性系数表明不同来源的菌之间的相关系数在44%~83%之间。关键词:氧化亚铁硫杆菌;RAPD ;亲缘关系中图分类号:Q933　　　文献标识码:A 　　　 文章编号:0253-9772(200401-0069-06 Studies of Polymorphisms of Thiobacillus Ferrooxidans Using RAPD HE Zhi 2Guo 1,HU Yue 2Hua 1,HU Wei 2Xin 2,ZHON G Hui 2,XU Jing 1,Zhu Min 2 (1.School of Resource Process and Bioengi neeri ng ,CS U ,Changsha 410083,Chi na ; 2.Molecular Biology Research Cent re ,Medical School of Xiangya ,CS U ,Changsha 410078,Chi na Abstract :Random amplified polymorphic DNA (RAPD was used in analyzing the polymorphisms of Thiobacillus f erroox 2idans from seven different places.Of the 20primers ,four could generate reproducible RAPD profiles ,and each one pro 2 duced 1~9bands.The similarity coefficients obtained from profiles generated by four primers among Thiobacillus Fer 2rooxidans were about 44%~83%. K ey w ords :Thiobacillus f errooxidans ;RAPD ;relationship 　　氧化亚铁硫杆菌是一类革兰氏阴性的化能无机营养细菌,是极端嗜酸性的专性自养细菌,最适宜生长p H 为2.0~3.5,广泛分布在硫化矿床的酸性废水中。这类细菌很早就被应用于贵重金属的浸出和回收,适合于从低品位的矿石中浸出稀有贵重金属。主要是通过氧化FeSO 4和FeS 2产生Fe 3+氧化剂,氧化金属硫化物使之变成可溶性的硫酸盐形式,称为细菌的间接作用[1];或者细菌直接作用于矿物表面氧化金属硫化物,称之为直接作用[2]。细菌浸出的方法具有低成本、低能耗、无污染等特点。美国有 25%左右的铜就是通过这种方法开采的[3]。此外 在含硫废水处理和煤的脱硫等方面也有重要的应用 前景。氧化亚铁硫杆菌也有一些限制其应用的特点,比如这类细菌的生长缓慢,细胞得率低,生产成本增加,而且氧化亚铁硫杆菌对对某些重金属离子缺乏抗性,而限制了其应用的范围。有研究表明,来源不同的氧化亚铁硫杆菌菌株对金属硫化矿物的浸出效果是不一样的,因而从各个矿山酸性废水中采集氧化亚铁硫杆菌,并对其氧化金属硫化矿物能力进行实验,以筛选出适应于不同底物作用的优良菌 株极为重要。 RAPD技术是由Williams等于1990年首先创立的一种DNA分子标记技术[4]。近年来分子标记技术发展迅速,其中常用的有RFL P、AFL P及ARD 等,这些方法均为选择性扩增特异的DNA片段,要求