日本落叶松小RNA文库构建及其microRNA鉴定.pdf

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林业科学研究2012,25(6):677~684 ForestResearch 文童编号:1001-1498(2012)06-0677-08 吴 涛1’2,张俊红1,韩素英3,杨文华1,李万峰1,齐力旺¨ (1.中国林业科学研究院林业研究所,细胞生物学实验室,北京100091; 2.云南省林业科学院,云南省森林植物培育与开发利用重点实验室,云南昆明65020l 3.中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,北京100091) 摘要:以2年生日本落叶松实生苗为材料构建其小RNA文库,对283个克隆进行POR验证后测序,通过生物信息学 分析鉴定文库中的microRNA并进行qRT·PCR验证。结果表明:(1)小RNA文库的体积为50mL,总库容量为5.25 ×106 cfu,重组率为92.6%,插入片段长度约65 miRl60a?miRl62a、miRl64b?miRl65a,miRl66a、miRl66a‘l 功能主要为转录因子、信号转导、胁迫抗性和代谢相关酶及未知功能蛋白, 关键词:日本落叶松;小RNA;文库;miRNA;转录组 中图分类号:S791.223 文献标识码:A of ConstructionofSmallRNA andCharacterization Library MiRNAsinLar/x kaempferi WUTao 1”,ZHANGJun—hon91,HANSu—yin93,YANGWen—hual,LIWan-fen91,QILi—wan91 ofCell Instituteof of (1.LaboratoryBiology,ResearchForestry,ChineseAcademy 100091,China; Forestry,Beijing ForestPlant and of 65020 2,Yunnan Cultivation KeyLaboratory,for Utilization,YunnanAcademyForestry,Kunming1,Yunnan,China; 3.ResearchInstituteofForest and of Ecology,EnvironmentProtection,ChineseAcademyForestry,Beijing100091.China) smallRNA ofneedle androottissueswascon— this mixed sRNA Abstract:Instudy,a library equally leaves,stem for of hundredand threerecombinants structed 2-year—oldseedlingJapaneselarch(如吨kaempferi).Twoeighty from were selected and weresearchedandeom— librarypaaially randomlysequenced.Thesesequencedsequenc

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