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蛋白质组学技术在肝损伤生物靶标技术的应用
文献解读:用蛋白质组学分析单核细胞來源的肝样细胞发现卩3整合素作为双氯芬酸诱导的 肝损伤的生物靶标
题目:Proteomics Analysis of Monocyte-Derived Hepatocyte-Like Cells Identifies Integrin Beta 3 as a Specific Biomarker for Drug?Induced Liver Injury by Diclofenac 期刊:Frontiers in pharmacology
影响因子:3.831
主要技术:蛋白质组学、流式细胞术
研究背景
药物诱导的肝损伤(iDLL)是导致肝移植失败或死亡的重要原因,是临床的一大挑战。 缺少研究iDLL的合适工具影响了研究iDLL的发展。本文作者通过蛋白质组学研究双氯芬 酸(Dicol)诱导单核细胞來源的肝样细胞(MH),鉴定到2700多个蛋白,经过筛选发现ITGB3 在双氯芬酸诱导后表达量增髙。
研究内容及结果
MH细胞处理
首先,分离PBMC诱导成MH细胞,随后检测Dicol的药物毒性;其次,选取无毒浓 度的Dicol处理MH细胞后,利用蛋白质组学筛选出药物处理后表达差异的蛋白。
I Isolation of V PBMCsmentioned in (Table 1)Cell collection and proteomics analysis
I Isolation of V PBMCs
mentioned in (Table 1)
Cell collection and proteomics analysis
I Generation
V of MH cells
Proteomics Toxicity analysis testing (see 1B)
Proteomics Toxicity analysis testing (see 1B)
图1MH细胞蛋白质组学流程
收集临床标本,分不通的组进行比较。
根据不同病人用药情况和比较方式,将病人分为几组:Diclo组(用过Diclo)、control (没 用过 Diclo)、DicloDILI 组(Diclo 引起的 IDILI)、Diclo-olhcrDILI 组(其它药物导致的 IDILI) 以及Control_otherDILI (其它药物的对照组)。
表1不同临床病人的分类比较方式
TABLE 11 Study subjects.
Diclofenac exposure
Yes
No
Comment
DIU duo to Dictofonac
Healthy
DIU du? to another drug
Othor AU
Total
4(DictoDLI)
3 (DidoJolGratOf)
(Dido^othorDIU)
(Dido_othQrAU)
12
n.a
(Control.hG^thy)
(Control.otherDU)
3 (Control.othorALJ)
10
Paoonts with DIU duo to Dictofonac
Subjects without sgns of livor injury
Patients with DIU due to another drug
Patents with acute 阳 injury o( non-drug cause
Total subjods: 22
蛋白质组学筛选差异蛋白
蛋白质组质谱鉴定到总共2700多个蛋白,通过生物信息学分析不同组间蛋白表达差异和不 通通路蛋白的占比情况。作者选取DicloDILI病人的MH细胞在Diclo处理后上调的前10 个差异蛋白,其中只有1个是膜蛋白即卩3整合素(ITGB3),最终从细胞粘附相关通路中选 収卩3整合素(ITGB3)做后续验证。
[|占#门白內
-3,5-3 -2,5-2 -L5-I -0,5 0 0,5 1 1,5 2 2,5 3I I I I 1 I I I I I I I 1 IDicloDILI Diclo_othcrALI Control healthy ControI^otherDILI Control othcrALI
-3,5-3 -2,5-2 -L5-I -0,5 0 0,5 1 1,5 2 2,5 3
I I I I 1 I I I I I I I 1 I
DicloDILI Diclo_othcrALI Control healthy ControI^otherDILI Control othcrALI
Dido otherDILl
Diclo tolerator
Pathway enrichment
DicloDIIJ treatcd |ot
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