拟南芥DNA探针的比较基因组原位杂交揭示的拟南芥与.pdfVIP

ISSN 中国生物化学与分子生物学报 2007 年 11 月 CN 　113870Q Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology 23 ( 11) :946～952 拟南芥 DNA 探针的比较基因组原位杂交揭示的拟南芥 与远缘植物基因组间的同源性 佘朝文1) , 2) , 　宋运淳2) ( 1) 怀化学院生物系 ,湖南怀化　418008 ;2) 武汉大学生命科学学院植物发育生物学教育部重点实验室 ,武汉　430072) 摘要 　采用生物素标记的拟南芥基因组 DNA 探针在 75 %杂交严谨度下对双子叶植物番茄、蚕豆和 ( 单子叶植物水稻、玉米、大麦的染色体进行了比较基因组荧光原位杂交 comparative genomic in situ ) hybridization ,cGISH 分析 , 以揭示拟南芥与远缘植物基因组间的同源性. cGISH 信号代表了拟南芥基 因组DNA 中的重复DNA 与靶物种染色体上同源序列的杂交. 探针 DNA 在所有靶物种的全部染色 体上都产生了杂交信号. 杂交信号为散在分布 ,并呈现随基因组增大 ,杂交信号增多 ,且分布更加分 ( ) 散的趋势. 所有靶物种的核仁组织区 NOR 都显示了明显强于其他区域的杂交信号 ,表明拟南芥基 因组DNA 探针可用于植物 NOR 的物理定位. 在所有的靶物种中 ,信号主要分布在染色体的臂中间 区和末端 ,着丝粒或近着丝粒区有少数信号分布. 大麦染色体显示了与 C和 N带不同的独特的 cGISH 信号带型 ,表明此探针可用于不同植物染色体的识别. 这些结果表明 ,拟南芥基因组与远缘 植物基因组之间 ,除 rDNA 和端粒重复序列外 ,还存在其它同源的重复 DNA ; 一些重复 DNA 序列在 被子植物分歧进化为单子叶和双子叶植物之前就已存在 ,虽经历了长期的进化过程 ,至今在远缘物 种之间仍保持了较高的同源性. 结果还提示 ,大基因组中古老而保守的重复 DNA 在进化过程中发 生了明显的扩增. 关键词 　拟南芥 ; 基因组同源性 ; 比较基因组原位杂交; 重复 DNA 中图分类号 　Q343 Genomic Homology Between Arabidopsis thaliana and Distantly Related Plants Revealed by Comparative Genomic in situ Hybridization with Arabidopsis DNA Probe 1) ,2) 2) SHE ChaoWen , SONG YunChun ( 1) Department of Biology , Huaihua University , Huaihua 　418008 , Hunan , China ; 2)