有参转录组结题报告.pdfVIP

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2020-02-12 发布于江苏
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有参转录组结题报告.pdf

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单单位位++转转录录组组分分析析网网页页版版结结题题报报告告 /0011//2299 目目录录 11 项项目目信信息息 11..11 基基本本思思想想 11..22 验验流流程程 11..22..11 样样本本检检测测 11..22..22 文文库库构构建建和和上上机机测测序序 11..33 信信息息分分析析流流程程 11..44 样样品品信信息息 22 数数据据过过滤滤 22..11 原原始始数数据据 22..22 数数据据过过滤滤统统计计 22..33 测测序序质质量量分分布布 22..44 测测序序碱碱基基分分布布 33 比比对对分分析析 33..11 比比对对率率分分析析 33..22 基基因因区区域域分分布布 33..33 均均一一性性分分析析 33..44 比比对对文文件件可可视视化化 44 表表达达量量分分析析 44..11 表表达达量量估估计计 44..11..11 表表达达量量分分布布统统计计 44..11..22 饱饱和和度度分分析析 44..11..33 样样品品验验的的聚聚类类 44..22 差差异异表表达达分分析析 44..22..11 差差异异表表达达分分析析统统计计结结果果 44..22..22 差差异异表表达达基基因因聚聚类类图图 44..22..33 差差异异表表达达基基因因统统计计结结果果注注释释 55 蛋蛋白白互互作作网网络络 66 功功能能分分析析 66..11 GGOO功功能能分分析析 66..11..11 差差异异表表达达基基因因的的GGOO统统计计 66..11..22 GGOO富富集集分分析析 66..22 GGOO富富集集DDAAGG 图图 66..33 KKEEGGGG通通路路分分析析 77 可可变变剪剪接接分分析析 77..11 可可变变剪剪切切分分析析 77..11..11 可可变变剪剪切切事事件件分分类类和和数数量量统统计计 77..11..22 可可变变剪剪切切事事件件结结构构和和表表达达量量 77..22 新新转转录录本本预预测测 88 变变异异分分析析 99 附附录录 99..11 参参考考文文献献 99..22 软软件件与与方方法法说说明明 99..33 结结果果目目录录 11 项项目目信信息息 11..11 基基本本思思想想安诺优达转录组测序，基于Illumina测序平台，通过研究某个物种在特定状态或者特定时期下所有的mRNA，针对际样品信息采用灵活的差异分析策略可以找到生物体不同时期、不同组织或不同个体间差异表达的mRNA，再通过软件进行功能注释，最终可以得到mRNA在生物体中参与生命活动的清晰生物信息图谱。 11..22 验验流流程程 11..22..11 样样本本检检测测安诺优达对总RNA的样本检测包括以下3种方法：（1）1% 的琼脂糖电泳检测RNA样品是否有降解以及杂质；（2）凯奥K5500分光光度计检测样品纯度（凯奥，北京）；（3）安捷伦2100 RNA Nano 6000 Assay Kit （Agilent