第九章 多相分类.pptVIP

第九章 多相分类 放线菌系统学的两个基本任务： 一是利用现代系统学的理论和手段，将分类的对象置于适当的分类界元； 二是研究分类单元（taxa）之间的系统发育关系。 多相分类(polyphasic systematics) 利用现代技术手段获得的放线菌表观和分子信息，进行放线菌的分类鉴定研究。 9.1 种的概念 “种”是最基本的分类单位(taxa) 目前大家比较接受的概念是：16S rRNA相似性小于98％（序列碱基差异数小于2obp)、DNA同源性小于70％为“种”的界限。 ------------这不是绝对的，也非唯一标准。 16S rRNA相似性在98.5％-99％，仍有50％可能是新种。当前不主张定变种或亚种。 9.2属的概念 16S rRNA相似性小于95％，且在进化树上形成稳定的独立分支（dade)，又具有特征性碱基，可以大体作为属的界限。 很多放线菌的细胞壁都同时含有L-DAP和me-so-DAP，难以按Lechevalier夫妇的分型原则划分成不同的氨基酸类型；全细胞糖的含量也同样难于分型。 在做属的描述时，就直接叙述16S rRNA特征性碱基和细胞壁氨基酸末端序列，细胞壁氨基酸、全细胞糖、磷脂、醒、脂肪酸等的组成。 9.3 值得进行分类鉴定的菌株 当前要完成一个菌株的多项分类，将其鉴定到种，一般需要3-6个月时间，至少5000元人民币的花费。 从发现新