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第二章 核酸化学;概 述;1. 脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid , DNA)
原核: 裸露的DNA分子集中于核区
真核: 细胞核DNA:与组蛋白、非组蛋白形成染色体
细胞器DNA:双链环形,一般裸露;第一节 核苷酸;㈠ 碱 基 ;嘌呤碱:腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G);;㈡ 戊 糖 ;;㈢ 核 苷 ;㈣ 核苷酸 ;脱氧腺嘌呤核苷酸(dAMP);鸟嘌呤核苷酸(GMP);核 苷;Nitrogenous base; 将核酸完全水解后可得到哪些组分? DNA和RNA的水解产物有何不同?; ATP是生物体内分布最广和最重要的一种核苷酸衍生物。它???结构如下:;腺苷酸及其多磷酸化合物;? 环核苷酸普遍存在于动植物及微生物中。;NAD:烟酰胺腺嘌呤二核苷酸
NADP:烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸
FAD:黄素腺嘌呤二核苷酸;一、DNA的一级结构; 在讨论有关核酸问题时,一般只关心其中碱基的种类和顺序,所以上式可以进一步简化为:
- PAPCPTPG - 或- PA-C-T-G-
----ACTG----;2. 排列顺序;二、DNA的二级结构;Chargaff 定律:;;DNA的Na盐纤维和DNA晶体的X光衍射分析
Franklin; 1953年,J. Watson和F. Crick 在前人研究工作的基础上,根据DNA结晶的X-衍射图谱和分子模型,提出了著名的DNA双螺旋结构模型,并对模型的生物学意义作出了科学的解释和预测。; 1. DNA分子由两条反向平行的多聚脱氧核苷酸链组成。一条链的走向为5’→3’,而另一条链的走向向为3’→5’。两条链沿一个假想的中心轴右旋平行盘绕,形成大沟与小沟。; 2. 磷酸和脱氧核糖作为不变的链骨架位于外侧,作为可变成分的碱基位于螺旋的内侧。链间的碱基按A=T和G C配对形成碱基平面,平面与纵轴近于垂直。; 3.螺旋横截面的直径约为2nm,相邻碱基平面的垂直距离为0.34nm,螺旋结构每隔10个碱基重复一次,间距为3.4nm。
;4. DNA双螺旋结构在生理条件下是很稳定的,稳定力量主要有两个:
碱基堆积力(base stacking force)
氢键(hydrogen bond);DNA双螺旋结构的多态性;;回文序列(palindromic sequence):指DNA序列中,以某一中心区域为对称轴,其两侧碱基序列正读和反读都相同的双螺旋结构。;发夹结构;镜像重复(mirror repeat):DNA序列反向重复,且存在于同一条链上。; 当DNA的一段寡嘧啶(寡嘌呤)构成镜像重复时可以形成三股螺旋(hinged DNA , H-DNA);三、DNA的三级结构;正超螺旋:3.4nm间距内碱基对数多于10个。
负超螺旋:3.4nm间距内碱基对数少于10个。;OH; 根据RNA的功能,可以分为mRNA(message RNA)、tRNA(transfer RNA)和rRNA(ribosomal RNA)三种。;一、tRNA的分子结构;氨基酸臂
D臂(二氢尿嘧啶臂)
D环
T?C臂
T?C环
额外环
AC臂(反密码臂)
AC环; 三级结构 —— 倒L型;; 原核生物rRNA有3类:5S、16S、23S
真核生物rRNA有4类: 5S、5.8S、18S、28S;; 顺反子(cistron):一个基因就是一个顺反子。
原核生物的mRNA一般是多顺反子。
真核生物的mRNA一般是单顺反子。;原核生物mRNA结构特点;5’-末端有一个甲基化的鸟苷酸,称为“帽子结构”
3’-末端有一段长达200个核苷酸左右的聚腺苷酸(polyA),称为 “尾结构” 。;帽子结构;第五节 核酸的性质;等电点 pI; 在核酸分子中,由于嘌呤碱和嘧啶碱具有共轭双键体系,因而具有独特的紫外线吸收光谱。一般在260nm左右有最大吸收峰,可以作为核酸定性和定量测定的依据。;;220; 核酸的变性(denaturation)
是指核酸分子中氢键断裂,双螺旋解开,变成无规则卷曲的过程。
核酸的复性(renaturation)
是指变性DNA的两条单链的碱基可以重新配对,恢复双螺旋结构。
;DNA变性;DNA复性; 能够引起核酸变性的因素很多。温度升高、酸碱度改变、甲醛和尿素等的存在均可引起核酸的变性。;? 影响Tm的因素主要有:
1. DNA的性质与组成
DNA的均一性:均一DNA,Tm值范围小
G-C含量: G-C含量高,Tm值越大
2. 溶液的性质
溶液离子强度高,
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