第二章2微生物的分类和鉴定教学提纲.pptVIP

第二章 微生物的分类和鉴定;目前已知的微生物种数为15～20万种，对它们进行分类、鉴定和命名等工作才能对纷繁的微生物类群有一清晰的轮廓。 生物种数：150万余种 微生物分类学(microbial taxonomy)是一门按微生物的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群(taxon)的科学。它的具体任务有三，即分类(classification)、鉴定(identification)和命名(nomenclature)。 ;第一节 微生物的分类;;（二）种的概念;模式种（typespecies 模式活标本） ;常用的几种分类概念;小种（亚种）：实验室中获得的微生物变异型称为小种或亚种。 型：自然界存在的差异较小的同种微生物的不同类型，称为型。如结核分支杆菌依其寄主的不同可分为人型、牛型和禽型。 菌株（品系）：来源不同的同种微生物的纯培养，均可称为菌株。 群：有些微生物的特征介于两种微生物之间，我们把这两种微生物及其中间类型统称为一个群 ;二、微生物的命名;Green algae;（一）俗名;（二）学名;　 例1：大肠埃希氏菌（简称大肠杆菌） 　　Escherichia coli（Migula）Castellani et Chalmers 1919 　　例2：枯草芽孢杆菌（简称枯草杆菌） 　　Bacillus subtilis（Ehrenberg）Cohn 1872 　　例3：结核分枝杆菌 　　Mycobacterium tuberculosis（Zopf）Lehmann et Newmann 1896 　　例4：丙酮丁醇梭菌 　　Clostridium acetobutylicum McCoy，Fred，Peterson et Hastings 1926 　　例5：铜绿假单胞菌 　　Pseudomonas aeruginosa（Schroeter）Migula 1920 　　例6：金黄色葡萄球菌 Staphylococcus aureus Rosenbach 1884;第二节 微生物的鉴定;鉴定工作步骤：; 不同的微生物往往有自己不同的重点鉴定指标。 1、细胞的形态和习性水平 观察细胞的形态特征、运动性、酶反应、营养要求和生长条件等。 2、细胞组分水平 细胞组成成分例如细胞壁成分，细胞氨基酸库，脂类，醌类，光合色素等的分析。;3、蛋白质水平 氨基酸序列分析、凝胶电泳和各种免疫标记技术。 4、核酸水平 核酸分子杂交，G+C mol ％值的测定，遗传信息的转化和转导，16S或18S rRNA寡核苷酸序列分析，重要基因序列分析和全基因组测序等。;经典的分类方法 在微生物分类学发展的早??，主要的分类鉴定指标尚为细胞的形态和习性，这类方法称作经典的分类鉴定方法。是相对于现代的分类鉴定方法而言的。 微生物分类鉴定的经典方法局限于利用常规的方法来鉴定微生物细胞的形态、习性和构造，主要是在第一个水平上进行的。 微生物分类鉴定理论和方法的发展：后三个水平 化学分类学；数值分类学;一、经典分类鉴定方法;经典的鉴定指标;二、现代分类鉴定方法;（一）微生物遗传型的鉴定;1．DNA碱基比例的测定 ;一般地说，同一种微生物，其种内各菌株间的G+Cmol％值可相差2.5～4.0％，相差过少（低于2％），则没有分类学上的意义；若相差在5％以上，可认为已是两个不同的种了；要是相差超过10％，则可考虑它们是属于不同的属。 因此，G+Cmol％值的用途主要在于排除不确切的分类单元，而不是用它去建立一个新的分类单元。　　 ;2．核酸分子杂交法 ;;3．rRNA寡核苷酸编目分析;4、微生物全基因组序列的测定;（二）细胞化学成分鉴定; 1．细胞壁的化学组分 ;2．全细胞水解液的糖型 ;3．磷酸类脂成分的分析;4．枝菌酸的分析 ;5．醌类的分析 ;　6．气相色谱技术用于微生物鉴定;（三）数值分类法（统计分类法）;数值分类的基本步骤为：