表观遗传学和表型课件.pptVIP

表观遗传学和跨代效应 种系传输 ? 对于环境在表观基因组上的影响的跨代遗 传被认为是表型改变的原因的可能的机制， 这种改变至少保持到 F3 代。 ? 在人类和动物中的研究都表明在 F0 代母亲 的初期的暴露将产生 F2 代的表型。 31 行为传输 ? 通过对小鼠的研究证明代与代之间的培养 行为不是通过种系遗传，而是行为传输， 在产后一周的母亲的行为会对后代产生直 接的影响 ? 近来研究表明，这种母系影响涉及 NGFIA （神经生长因子诱导蛋白 A ）的 DNA 甲基化 和组蛋白修饰 32 环境表观遗传学的关键问题 ? 当解除环境因子对疾病的控制时，哪些人 类基因能增强疾病易感性？ ? 哪些环境因子有害的改变表观基因组学， 并且以什么剂量改变？ ? 表观基因学在生殖、发育和疾病病原上的 作用？ ? 营养补充可不可以减少化学和物理因子对 表观基因组的有害影响？ 33 环境、表观遗传学和表型 张媛媛 2009.12.11 1 讨论内容 ? 基因和环境在人类疾病中的相互作用 ? 表观遗传学对表型的影响 2 一、基因和环境相互作用 ? 研究基因和环境的相互作用目的：描述遗传 和环境因子是怎样联合影响人类疾病的发展。 ? 可以用一些模型描述基因 — 环境的相互作用， 这些模型考虑了环境暴露修饰遗传影响的多 种方式。 ? 研究设计的选择、样本大小和基因分型技术 都影响基因 — 环境相互作用的分析和解释 3 研究基因 — 环境相互作用的原因 ? 获得对可归因种群风险的更好的评估； ? 通过在遗传易感个体中测试环境因子，加 强环境因子和疾病的关联； ? 用集中在与疾病相关的生物路径，与生物 路径相关的环境因子的易感基因信息，有 助于解剖人类疾病机制； ? 用生物路径的信息设计新的预防和治疗策 略； 4 描述基因 — 环境相互作用 ? 遗传倾向可以从家族史、表型或 DNA 序列 的直接分析推得；环境因子可以在流行病 学研究中用自我报告的信息被测量。但很 多遗传倾向的研究得到很少的关于环境和 生活方式的信息；相似，不相关个体的流 行病学研究获得很少的直接评估遗传变异 的 DNA 信息。因此要整合二者的数据进行 相互作用的研究。 5 1 、定性模型 ? 最简单的是二分基因型（基因变异携带者 和非携带者）和二分暴露（暴露和非暴 露），这四种可能的组合以 2X4 表的形式表 现，相对风险可以表现在图上 6 2 、统计模型 ? 除了上述的一些描述相互作用的定性模型 外，还有一些评估相互作用统计显著性的 方法。 ? 对于二分环境和基因型的最简单的情况， 涉及了检验联合环境暴露后的相对风险比 单独环境或基因时，是变大还是变小？ ? 另一个常用的检验是比例差而不是相对风 险，基因和环境的联合影响与期望的不同， 这个期望是指，单独环境和基因情况下的 比例相加。 9 3 、生物可靠性 ? 在一个大数目基因型和很多环境暴露的数 据集中筛选可能的基因 — 环境相互作用大 大增加了在传统的统计显著性水平发现假 阳性结果。 ? 因为大多数研究对检测中等的相互作用力 量不足，因此需要一个较小的 p-value 来抵 消这个问题，这就将导致真阳性相互作用 作为显著性的一个较低的概率。 10 ? 虽然对影响基因调控的变异的科学还在起 步阶段，但对改变基因功能的基因变异的 限制分析很有吸引力。 ? 定义一个合理的先验有很大的主观性，一 个人的合理候选可能是另一个人的低概率 假设 11 对基因 — 环境相互作用的研究设计 ? 基于家系的研究： 多代间的家谱分析提供了对一个假设的初步评估， 这个假设是指一个变异的外显率随时间改变， 这就暗示：生活方式和环境的改变影响基因外 显率。 局限性：这种性质的评估只能用于相对的高渗透 基因突变，也就是说，引起清楚地家族聚集性 的足够高的外显率的基因变异。 整合环境数据到家谱中，或其他的基于家系的 研究（同胞对设计或病例 — 父母设计）允许对 特殊的基因 — 环境相互作用的直接确定。 12 在无关个体中的关联研究 1 、 追溯“病例 — 对照”研究 环境和生活方式的数据以及用于 DNA 和生 物标志物研究的样本都是从病例组中疾病 的诊断后获得的。 2 、 预期研究 环境和生活方式数据从研究的最开始获得， 用于 DNA 和生物标志物研究的样本也是从 研究开始的时候获得。 13 追溯研究 ? 追溯研究主要限制因素是，会存在一些偏 差。比如：选择偏差和回忆偏差。 ?