2019年遗传学课件14第十三章基因组学.ppt

第十三章 基因组学 基因组学 (genomics) 是遗传学研究进入分子 水平后发展起来的一个分支，主要研究生物 体全基因组 (genome) 的分子特征。 基因组学强调的是以基因组为单位，而不是 以单个基因为单位作为研究对象，因此，基 因组学的研究目标是认识基因组的结构、功 能及进化，弄清基因组包含的遗传物质的全 部信息及相互关系，为最终充分合理地利用 各种有效资源，为预防和治疗人类遗传疾病 提供科学依据。 基因组学的重要组成部分是基因 组计划， 如人类、水稻基因组计 划， 大体可分为： 1 、构建基因组的遗传图谱 2 、构建基因组的物理图谱 3 、测定基因组 DNA 的全部序列 4 、构建基因组的转录本图谱 5 、分析基因组的功能 基因组计划研究开始于 1990 年，美国国 立卫生研究院 (NIH) 和能源部 (DOE) 联合启动 了被誉为“人体阿波罗计划”的“人类基因 组计划” (human genome project ， HGP) 。 在美国提出人类基因组计划后，英、法 、日、前苏联、中等，也相继启动了类似的 研究项目。 2000 年 6 月 26 日，各国科学家公布了人 类基因组工作草图， 2001 年 8 月 26 日，人类 基因组计划中国部分测序项目汇报及联合验 收会在京召开，标志人类基因组“中国卷” 1992 年 8 月，中国根据国情正式 宣布实施自己的“水稻基因组研究 计划”，已完成水稻基因组物理图 谱的构建 。 2002 年 4 月 5 日，《 Science 》以 14 页的篇幅刊登和宣布中国科学家 独立绘制完成的水稻基因组草图序 列（ 4.6 亿） 一、基因组图谱的构建 在进行大规模序列测定之前，构建基因 组图谱是测定大基因组全部核苷酸序列 的重要一环。基因组图谱可作为序列测 定中制定测序方案的依据，以便先重后 轻地分析基因，锚定测知的核酸序列在 染色体上的位置。 因此，在人类基因组 计划实施过程中，首先用了六年时间构 建高密度的基因组图谱，然后才进入测 序工作。 1 、 遗传图谱 （ 1 ）图谱标记 图谱构建中需要可以鉴别的标记 (marker) ，在构建遗传图谱中，可用基 因和 DNA 作为标记。 基因标记： 用基因作为标记，分析各基 因间的连锁关系及遗传距离，绘制出连 锁遗传图谱 DNA 标记： 限制性内切酶多型性 (RFLP) 、简单序列长度多型性 (SSLP) 、单核苷 酸多型性 (SNPs) （ 2 ）遗传图谱的构建 人类基因组遗传图谱的构建： 人类的遗传图谱是利用家系分析法，在对 8 个家系的 134 个成员的分析中，主要根据 5264 个 STR 标记绘制而成的。利用这些家系 的资料绘制第 1 至 22 号染色体图谱。对于 X 染 色体图谱，还利用了来自另外 12 个家系， 170 个成员的资料绘制而成。 将 5264 个标记定位在 2335 个位点，据此 构建的人类基因组遗传图谱的密度为每个标 记 599 Kb 。 植物基因组遗传图谱的构建： 选择亲本 产生构图群体 遗传标记的染色体定位 标记间的连锁分析 P 1 ×P 2 P 3 ×F 1 回交群体 单倍体 DH 三交群体 F 2 RIL 连续回交 连续自交 染色体加倍 组织培养 2 、 物理图谱 由于遗传图谱的分辨率有限、精确性不 高，所以还要构建物理图谱。 基因组物理图谱的构建主要有三种途径： ① 限制性酶图谱 ② 荧光原位杂交技术 (FISH) ③ 序列标签位点 (STS) 如表达的序列标签 (EST) ， 来自 cDNA 图 9 － 27 酵母菌第 III 染色体遗传图谱 (A) 与物理图谱 (B) 的 比较 chaI glkI his4 leu2 SUP53 Centromere pgkI pet18 cryI MAT thr4 SUP61 ABP1 chaI glkI his4 SUP53 leu2 Centromere pgkI pet18 cryI MAT thr4 SUP61 ABP1 A B 二、基因组图谱的应用： 1 、基因组序列测定 2 、基因定位 3 、基因组比较分析 4 、分子标记辅助选择 5 、基因的克隆与分离 三、后基因组学 后基因组学 (post-genomics) 是在完成 基因组图谱构建以及全部序列测定的 基础上，进一步研究全基因组的基因