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第四章 DNA的复制
;中心法则 (The Central Dogma);核 酸-储存和传递遗传信息蛋白质- 构成生物体的基本组分, 执行各种生理功能;第一节 DNA复制的方式;一、复制可能的几种方式;密度梯度实验 ;;(semiconservative replication);AGAACTT; 按半保留复制方式,子代DNA与亲代DNA 的碱基序列一致,即子代保留了亲代的全部遗传信息 ,体现了遗传的保守性。;第二节 复制的原点、方向和方式 ;复制起点(origin) 是DNA复制所必需的一段特殊的DNA序列。细菌染色体、质粒和一些病毒的环形DNA分子通常具有比较明显的复制起点。
E.coli的ori C由两种类型的重复序列组成,一类是3个连续的13 bp序列,其中富含A-T;另一类是反向重复出现4次的9 bp序列。后者对于结合Dna A蛋白以起始DNA复制十分重要。 ;复制起始点(E.coli-oriC); DNA分子复制时,在亲代双链分子一个特定区域内打开,随之以两股链为模板复制生成两个子代DNA双链分子。开始时,复制起始点呈现一叉形(或Y形),称之为复制叉(replication fork)。
复制进行中,复制叉向前移动 ; 复制时DNA双链解开分成二股单链?新链沿着张开的二股单链生成,复制中形成的这种 Y 字形的结构称为复制叉;DNA的半不连续续复制
因为DNA双螺旋的两条链是反向平行的,而DNA合成的方向只能是5?→3?,所以在DNA复制时,1条链的合成方向和复制叉的前进方向相同,可以连续复制,这条链叫前导链(1eading strand);而另一条链的合成方向和复制叉的前进方向正好相反,不能连续复制,只能分成几个片段合成,故称为滞后链(lagging strand),又称后随链。DNA的这种复制方式是半不连续复制(semidiscontinuous replication)。
因此,复制叉是不对称的。
滞后链片段又叫冈崎片段,它们合成后再连接起来。 ;DNA复制的酶学;DNA 复制的物质基础; 在复制叉处进行复杂的DNA复制过程中,除DNA聚合酶外,需要许多相关的酶和蛋白因子参与:;RNA引物
DNA链不能从头(de novo)合成。在DNA复制开始时必须先合成一小段RNA作为引物(primer),从它的3’羟基开始合成DNA链,这一过程叫引发(priming)。待DNA链或片段合成结束,再将引物切除。
先导链
后随链; 在研究复制时,将与复制有关的蛋白质命名为:
Dna A, Dna B, Dna C,‥‥‥ Dna X;特 性;(一) DNA聚合酶催化的反应;聚合反应的特点:;5’ A G C T T C A G G A T A ? 3’
| | | | | | | | | | |;(二) DNA聚合酶的分类;DNA聚合酶I和DNA聚合酶Ⅱ ;323个氨基酸;;DNA聚合酶Ⅱ是细胞正常生长中一种次要成分,可能与DNA聚合酶Ⅰ类似。;DNA聚合酶Ⅲ;;2、真核生物的DNA聚合酶;真核生物的DNA聚合酶;二、解 链、 解 旋 酶 类;(二) 单链DNA结合蛋白(SSB);(三)DNA拓扑异构酶;拓扑异构酶作用特点:
既能水解 、又能连接磷酸二酯键;拓扑异构酶Ⅰ;三、引物酶和引发体;冈崎片段的合成需要经过引发、延伸、引物RNA的去除、缺口填补及切刻连接等步骤;四、DNA连接酶 (DNA ligase); 真核生物和T4噬菌体利用以ATP作为腺苷酰基的供体,而原核生物则以NAD+为辅因子,催化的反应过程如下:
(1)酶的活化 NAD+或ATP中的腺苷酰基(AMP)与酶活性中心的赖氨酸残基的ε-NH2以磷酰胺键结合,形成共价中间体酶-AMP。
酶 + NAD+ (ATP)中酶 → AMP- NMN (PPi);(2)腺苷酰化DNA 酶-AMP将腺苷酰基(AMP)转移给DNA切口处的5?磷酰基团,以焦磷酸键的形式活化,形成AMP-P-DNA。
酶- AMP + 5?- P-DNA → 酶十AMP-5?- P-DNA
(3)亲核进攻完成DNA连接 通过相邻DNA的3?羟基对活化的磷原子进行亲核进攻,生成3?,5?-磷酸二酯键,同时释放出AMP。
DNA-3?-OH + AMP-5?-P-DNA → AMP + DNA-3?-O-5?-P-DNA; DNA生物合成过程;G1;一、复
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