分子遗传的图谱构建.pptVIP

第三章分子图谱的构建 分子图谱构建的步骤: 1.选择适合作图的DNA标记; 2.根据遗传材料之间的DNA多态性,选择用 于建立作图群体的亲本组合; 3.建立具有大量DNA标记处于分离状态的分 离群体或衍生系 4.测定作图群体中不同个体或株系的标记基 因型 5.对标记基因型数据进行连锁分析,构建标 记连锁图。 第一节作图群体的建立 要构建DNA标记连锁图谱,必须建立作图群 体。建立作图群体需要考虑的重要因素包 括亲本的选配、分离群体类型的选择及群 体大小的确定等。 、亲本的选配 ①首先要考虑亲本间的DNA多态性。 ②选择亲本时应尽量选用纯度高的材料,并 进一步通过自交进行纯化。 ③要考虑杂交后代的可育性。 ④选配亲本时还应对亲本及其F1杂种进行细 胞学鉴定。 二、分离群体类型的选择 根据其遗传稳定性可将分离群体分成两大类: ·一类称为暂时性分离群体,如F2、F3、F4、BC、 三交群体等,这类群体中分离单位是个体,一经 自交或近交其遗传组成就会发生变化,无法永久 使用。 另一类称为永久性分离群体,如RI、DH群体等, 这类群体中分离单位是株系,不同株系之间存在 基因型的差异,而株系内个体间的基因型是相同 且纯合的,是自交不分离的。这类群体可通过自 交或近交繁殖后代,而不会改变群体的遗传组成, 可以永久使用。 (一)F2代群体 优点: a)自花授粉植物,还是异花授粉植物,建立F2群 体都是容易的。 缺点 a)存在杂合基因型。对于显性标记,将无法识别 显性纯合基因型和杂合基因型。 b)由于这种基因型信息简并现象的存在,会降低 作图的精度 C)为了提高精度,减小误差,则必须使用较大的 群体,从而会增加DNA标记分析的费用。 d)不易长期保存,有性繁殖一代后,群体的遗传 结构就会发生变化。 (二)Bc1群体 优点 a)Bc1群体中每一分离的基因座只有两种基因型, 它直接反映了F1代配子的分离比例。 b)可以用来检验雌、雄配子在基因间的重组率上 是否存在差异 缺点 a)不能长期保存。 b)对于一些人工杂交比较困难的植物,BC1群体 也不太合适,因为一是难以建立较大的BC1群 体,二是容易出现假杂种,造成作图的误差。 (三)R群体 R(重组自交系)群体是杂种后代经过多代 自交而产生的一种作图群体,通常从F2代 开始,采用单粒传的方法来建立 优点:可以长期使用,可以进行重复试验 缺点: a)构建Rl群体要花费很长时间 b)异花授粉植物由于存在自交衰退和不结实 现象,建立R群体也比较困难。 (四)DH群体 高等植物的单倍体( Haploid)是含有配子染色体 数的个体。单倍体经过染色体加倍形成的二倍体 称为加倍单倍体或双单倍体(DH)。 优点: a)DH植株是纯合的,自交后即产生纯系,因此DH 群体可以稳定繁殖,长期使用,是一种永久性群 体 b)DH群体的遗传结构直接反映了F1配子中基因的 分离和重组,因此DH群体与BC1群体一样,作 图效率是最高的。 C)DH群体跟Rl群体一样,可以反复使用,重复试 验,因此也特别适合于QTL定位的研究。 缺点: a)有些植物的花药培养非常困难,就无法通 过花培来建立DH群体。 b)植物的花培能力跟基因型关系较大,因而 花培过程会对不同基因型的花粉产生选择 效应,从而破坏DH群体的遗传结构,造 成较严重的偏分离现象,这会影响遗传作 图的准确性。