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高通量组学技术简介
2014-11-26
目录
代谢组学及其相关技术
蛋白质组学及其相关技术
糖组学及其相关技术
脂质组学及其相关技术
代谢组学
●代谢物组学( metabolomics)是在后基因组学时
代兴起的一门跨领域学科,其主要目标是定量的
研究生命体对外界刺激、病理生理变化、以及本
身基因突变而产生的其体内代谢物水平的多元动
态反应。
代谢物组学诞生于上个世纪末,由英国伦敦帝国
大学 Jeremy Nicholson教授创立,之后得到迅速
发展并渗透到多项领域,比如疾病诊断、医药研
制开发、营养食品科学、毒理学、环境学,植物
学等与人类健康护理密切相关的领域。
常用技术手段
色谱质谱联用技术
●色谱是分离混合物的有效方法,但难以得到结构信
息,主要靠与标样对比来达到未知物结构的推定
质谱法提供了丰富的结构信息,用样又是几种谱学
方法中用量最少的。因此色谱与质谱的结合,成为
分离和鉴定复杂样品的理想手段,这是单独采用色
谱、质谱所不及的,同时也不存在类似于NR技术
灵敏度低、检测动态范围窄弱点,有较高的灵敏度
和专属性。
色质联用技术已在代谢组学领域得到广泛应用,特
别是液质联用(LC-MS)、气质联用(GC-Ms)以及毛
细管电泳-质谱联用技术(CE-MS)。LC-MS的应用涉
及毒理、植物代谢、遗传学、真菌的代谢等诸多
领域的不同类小分子物质的定性与定量。GCM要
求足够的蒸气压和被分析物的热稳定性好,特别对
极性物质的分析前要进行样品的衍生化处理。但
其高效、高选择性、高灵敏度、用量少和分析速
度快的优点是其得到广泛应用的主要原因。
GC与T0F/MS以及四极杆质谱的联用在代谢组学的
研究中发挥了自身的优越性。CE-MS也是代谢组学
中强大的分析工具。Soga等分析了细菌代谢物经
三重CE分离后的近干种小分子物质有利于代谢物
的系统性分析。此外,毛细管电色谱( capillary
electrochromatography,CEC),与质谱的联用在
蛋白、多肽、氨基酸和糖类的分析中得到应用。
●核磁共振技术
●核磁共振( nuclearmagneticresonance,NR)是
种基于具有自旋性质的原子核在核外磁场作用下,
吸收射频辐射而产生能级跃迁的谱学技术。其特
点为:不破坏样品的结构和性质,无辐射损伤;可在
一定的温度和缓冲液范围内选择实验条件,能够在
接近生理条件下进行实验;可设计多种编辑手段,
实验方法灵活多样。基于这种特点核磁共振技术
对完整器官或组织细胞內许多微量代谢组分进行
检测,得到相应的生物体代谢物信息。
●综合分析这些信息所反映的生物学意义,可了解生
物体代谢的规律。二维和多维的核磁共振技术也
成为了代谢组学研究领域的重要技术。另外,NMR
技术还可以和色谱技术联用,充分发挥各自优势,
达到更为理想的分析效果。相关的高性能联用技
术将会用于小分子代谢物的定性与定量。
代谢组学的优势与劣势
分析技术平台成熟稳定
析与生物掌重现性好
分势
样品成本
动态的分析
物学的量续位点
复杂的数据
H代谢纽H有建立方法标准
无需预选样品
环境領域的研究应用
少专业的科研人员
动物苧试猃提供经验
多个组学的联台
缺少怀性的假设
其于网结的诊断体系
中心实验路径的优点
蛋白质组学
蛋白质组定义为一种基因组所表达的全部蛋白质。
因蛋白质组具有时空性和可调节性,蛋白质组的概
念实际指在特定时刻、特定环境和实验条件下基
因组所表达的全部蛋白质。
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