多小穗小麦种质10-A穗部相关性状的基因定位.pdfVIP

中文摘要 小麦是世界上重要的粮食作物之一。小麦穗部性状对小麦最终产量的形成具有重 要贡献。其中，小穗数、千粒重和芒长是小麦穗部性状的重要组成。本研究采用集群 分离分析（bulked segregant analysis ，BSA ）法，利用小麦660K SNP 芯片，对多小穗 种质10-A 构建的10-A/BE89 F7 RIL 群体的小穗数和芒长，10-A/B39 F6 RIL 群体的千 粒重和芒长进行了初步的基因定位，并结合 qRT-PCR 分析筛选候选基因，为相关性 状的精细定位、基因克隆和分子标记辅助育种奠定基础。本研究主要研究结果如下： （1）田间性状调查表明，10-A 与BE89 和B39 在小穗数、千粒重和芒长均存在 显著差异。群体 10-A/BE89 F7 的平均小穗数和芒长分别为22.35 和3.63cm，变异系 数为10.55%和63.67%，群体10-A/B39 F6 平均千粒重和芒长分别为47.3g 和3.78cm， 变异系数为21.47%和72.81% 。选择群体中各性状30 个极大值系和30 个极小值系分 别组成极值混合池。利用小麦660K SNP 芯片检测亲本和极值混合池，在10-A/BE89 群体中共检测到5070 个多态性SNP 位点，其中4A 最高有518 个，4D 最少为20 个； 在 10-A/B39 群体中共检测到3923 个多态性SNP 位点，3B 最多达865 个，4D 最少 仅16 个。 （2 ）在10-A/BE89 群体小穗数极端池间共检测到 177 个差异SNP，在6B 上检 测到p-SNP 比值（染色体上的混合池间差异SNP 数与亲本间差异SNP 数比值）最高， 为22.75% 。其中在物理位置 170Mb 处 c-SNP 比值（滑动区间内混合池间差异SNP 数与亲本间差异SNP 数比值）最大，选取该位置20Mb 区段为候选区间C1，共包含 3 个差异SNP 位点。该区间共检索到 109 个候选基因，其中3 个基因与SNP 位点有 关。 （3 ）在10-A/B39 群体的千粒重极端池间检测到197 个差异SNP。在5A 上p-SNP 比值最大，为35.9% 。c-SNP 比值在物理位置80Mb 时最大，取70-90Mb 为候选区间 C3，并推测为控制千粒重的新区间。该区间共检索到106 个候选基因，有20 个基因 与差异SNP 有关。 （4 ）芒长混合池间p-SNP 比值在7B （10-A/BE89 群体）和3B （10-A/B39 群体） 最大，分别为10.07%和29.83% 。在7B 的760Mb 处上c-SNP 比值最大，取750-770Mb 区间为候选区域C2，包含了25 个候选基因，其中9 个基因与差异SNP 位点有关。 I 在 3B 位置 270Mb 和 310Mb 上 c-SNP 比值最大，分别取区段 260-280Mb 和 300Mb-310Mb 为候选区间C4 和C5 。在两个区间内共检索到了64 个候选基因，其中 有10 个基因与多态性SNP 关联。所检测到的3 个区间可能是控制芒长的新位点。 （5 ）从5 个候选区域共筛选到42 个候选基因，经RT-PCR 筛选到亲本间差异的 小穗数、千粒重和芒长候选基因分别为1 个、4 个和5 个。进一步的qRT-PCR 分析表 明，千粒重候选基因TaAPRT-5A 和TaUFO-5A，芒长候选基因TaAL7B.2 在供试材料 间存在显著差异。其中，TaAPRT 的同源基因编码腺嘌呤磷酸核糖转移酶 （APRT ）， TaUFO 的同源基因编码异常花生器官（UFO）蛋白，而TaAL7B.2 在数据库中没有注 释信息。其余7 个候选基因在亲本验证材料中均无显著差异。 关键词：小麦；集群分离分析法 （BSA ）；穗部性状；基因定位；qRT-PCR II ABSTRACT Wheat is one of the most important crops in the world. Wheat spike-related traits have an important contribution to fin