小麦早抽穗突变体eh1的基因定位与遗传分析.pdfVIP

摘 要 抽穗期对于小麦(Triticum aestivum L.)适应不同的生态环境条件至关重要，是小麦高产稳产育 种关注的重要目标性状之一。小麦抽穗期主要受春化基因和光周期基因调控。这两类基因中的各 种等位变异是小麦具有广适能力的遗传基础。本研究以小麦早抽穗突变eh1 为材料，拟通过BSA 分析和 QTL 作图等方法鉴定与小麦抽穗期相关的数量性状位点，阐明 eh1 早抽穗的遗传机制。 主要研究结果如下： 1. 以突变体eh1 和轮选987 为亲本构建的重组自交系群体为材料，通过BSR-Seq 和QTL 作 图等方法在小麦5B 染色体检测到一个稳定的QTL，进一步开发分子标记将该QTL 定位至3.31 cM 范围。通过开发新的诊断标记鉴定了eh1 和野生型中春化基因VRN-B1 的第一个内含子存在的大 片段缺失。重组自交系群体验证表明该QTL 是由VRN-B1 中的大片段缺失所致并且群体中该位点 的变异是由于eh1 和轮选987 两个亲本的遗传背景差异引入。序列比对分析进一步验证了eh1 和 野生型中 VRN-B1 基因存在的6850 bp 缺失。测序分析表明eh1 中VRN-B1 基因发生了37 bp 缺失 突变，该突变与6850 bp 大片段缺失在重组自交系群体中共分离。进一步通过eh1 和野生型构建 的F2 群体分析表明eh1 中的37 bp 缺失突变与抽穗期没有关联。 2. 基于660K 芯片的BSA 分析表明2A 染色体存在影响重组自交系群体抽穗期的位点，进一 步开发分子标记进行QTL 作图验证了该QTL 并将其定位至2A 染色体138.16— 141.49 Mb 范围。 对该染色体上光周期基因Ppd-A1 的序列分析表明该基因在突变体eh1 和轮选987 两个材料间没 有变异。突变体eh1 中Ppd-A1 基因下游发生了131 bp 缺失突变，该突变对重组自交系群体的抽 穗期没有显著影响。 3. 以突变体eh1 和野生型中原9 号为亲本构建的F2 群体为材料，通过基于外显子捕获测序 的BSA 分析和QTL 作图等方法在小麦2D 和7D 染色体分别检测到与抽穗期显著关联的位点。进 一步在7D 染色体开发分子标记进行QTL 作图将该位点定位至3.47 cM 范围内，对应参考基因组 的物理位置为2.54 Mb 。外显子捕获测序的结果表明候选区间内的春化基因VRN-D3 在突变体eh1 和野生型之间存在单碱基突变。进一步对该基因进行测序验证了该基因在eh1 中发生的C 碱基插 入。表型分析表明该突变会导致突变体平均提前8 天抽穗。根据BSA 分析和 VRN-D3 鉴定的结 果推断2D 染色体也存在影响F2 群体抽穗期差异的位点。在该染色体进行QTL 作图验证了此位 点的存在并将其命名为Qhd.caas.2D 。通过加密分子标记将该位点定位至3.94 cM 范围内。双因 素方差分析表明VRN-D3 与Qhd.caas.2D 在F2 群体中存在上位性效应。 本研究以小麦早抽穗突变体eh1 为核心材料，在多条染色体上分别检测到影响小麦抽穗期的 QTL 。通过开发诊断标记鉴定了5B 染色体上的QTL 是由于春化基因VRN-B1 存在的变异所致并 阐述了该变异对抽穗期的影响。同时鉴定了7D 染色体上春化基因 VRN-D3 发生的单碱基突变会 导致小麦提前抽穗。上述春化基因的鉴定将进一步加深对小麦抽穗的遗传机制的理解。鉴定的小 麦抽穗期位点为图位克隆相关基因提供基础，也为培育适应不同生态环境的小麦新品种提供理论 支撑。 关键词：小麦，抽穗期，数量性状位点，春化基因，混池分析 I Abstract Heading time plays a pivotal role in adaptability to different ecotypes and environmental conditions in wheat (Triticum aestivum L.), which is one of the important target traits for breeding with high yield stability. The heading time o