利用定向选择系解析鸡肌内脂肪沉积的分子机理.pdfVIP

摘 要 随着肉鸡生长速度和饲料转化效率的不断提高，鸡肉产品的品质问题日益突出，难以满 足消费者对优质畜产品日益增长的需求。肌内脂肪（Intramuscular fat，IMF ）作为改善鸡肉 品质的重要经济性状，其沉积调控是近年来肉鸡领域的研究热点。受到生理特点、表型精准 度等多种因素的限制，目前对于鸡IMF 沉积机理的解析仍非常有限。本研究基于IMF 选择 系和对照系胸肌组织中脂质代谢差异，借助高通量测序技术挖掘影响IMF 性状的关键基因， 解析鸡IMF 沉积的分子机理，为优质肉鸡生产提供理论支撑。 随机选取第十六世代IMF 选择系（n = 256 ）和对照系（n = 264 ）共计520 只母鸡，测 定胸肌组织中IMF 含量、脂质组成及脂肪酸组成。结果表明，IMF 的主要组分中仅甘油三 酯（Triglyceride ，TG ）含量在选择系中显著地高于对照系（P 0.01 ），且与IMF 含量呈正 相关。另外，发现C14:0、C16:1 以及C18:1n9c 等长链脂肪酸比例增加可能有利于TG 合成， 从而引起选择系胸肌组织中IMF 含量的增加。 首先利用鸡55K SNP 芯片对IMF 选择系和对照系各30 只随机个体进行群体结构和选 择信号分析，证明两个系存在遗传分化；之后对IMF 选择系和对照系共520 只母鸡进行全 基因组重测序。全基因组关联分析（Genome-wide association analysis ，GWAS ）发现1 号染 色体上存在长约 1.657 Mb 与胸肌TG 含量性状关联的QTL，其中包括24 个与性状显著关 联的SNPs，突变后均有利于提高胸肌TG 含量；采用GWAS 与选择信号联合分析将影响TG 含量的染色体区域缩减至424 Kb （chr1:31,826,000-32,250,000 ）的区域；结合基因注释和胸 肌发育转录组表达分析，鉴定出SLC16A7 与LRIG3 可能为调控鸡胸肌组织TG 合成的候选 基因。 利用胸肌 TG 高低组个体的转录组数据, 发现 SLC16A7 和脂肪酸代谢以及甘油三酯酯 化相关的 ACLY 、ACSL5 、CD36、CITED4、ELOVL5 、ELOVL7 、FABP4 、FABP5 、FADS2 、 SCD5 、LPL 、PLIN1 、PPARG 和RXRG 等基因在高TG 组中表达显著升高（P 0.05 ），而脂 解相关基因的表达显著降低或者无差异；进一步的加权基因共表达网络分析发现，SLC16A7 与ACSL5 、CITED4、ELOVL5 、ELOVL7 、FABP5 、FADS2 、PLIN1 、PPARG 和RXRG 等基因 存在共表达关系，且均与TG 含量、IMF 含量和C14:0、C14:1、C16:0、C16:1 和C18:1n9c 等脂肪酸含量存在显著正相关。对SLC16A7 与其共表达基因进行KEGG 分析发现，经典的 介导脂肪代谢的PPAR 信号通路被显著富集。而LRIG3 在高低TG 组表达并不差异，且与 TG、IMF、C14:0、C14:1、C16:1 和 C18:1n9c 等脂肪酸含量均不显著相关。以上结果提示 SLC16A7 在鸡胸肌中参与了TG 合成的调控。 综上，本研究鉴定SLC16A7 是选择系肌肉组织中TG 合成的关键调控基因；发现了鸡 肌肉组织中一种IMF 沉积调控新途径：SLC16A7 与脂肪酸代谢、脂肪沉积相关的基因共表 达，调控脂肪酸（C14:0、C14:1、C16:0、C16:1 和C18:1n9c 等）代谢进而促进TG 沉积。 关键词：肌内脂肪，SLC16A7 基因，代谢途径，鸡 I Abstract With the increasing growth rate and feed conversion efficiency, the quality problems of chicken meat have become increasingly prominent, which is difficult to meet the growing demand of consumers for high-quality livestock p