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不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数目得要求
不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数目得要求
酶
寡核苷酸序列
切割率%
2 hr
20 hr
Acc I
GGTCGACC ?CGGTCGACCG CCGGTCGACCGG
0 0 ?0
0 ?0 0
Afl III
CACATGTG CCACATGTGG ?CCCACATGTGGG
0 90 ?90
0 90 >90
Asc I
GGCGCGCC AGGCGCGCCT ?TTGGCGCGCCAA
90 ?90 〉90
〉90 ?〉90 >90
Ava I
CCCCGGGG ?CCCCCGGGGG ?TCCCCCGGGGGA
50 ?90 ?90
〉90 ?90 ?〉90
BamH I
CGGATCCG ?CGGGATCCCG CGCGGATCCGCG
10 ?〉90 ?>90
25 〉90 ?90
Bgl II
CAGATCTG ?GAAGATCTTC ?GGAAGATCTTCC
0 75 ?25
0 ?>90 ?90
BssH II
GGCGCGCC AGGCGCGCCT TTGGCGCGCCAA
0 0 ?50
0 ?0 90
BstE II
GGGT(A/T)ACCC
0
10
BstX I
AACTGCAGAACCAATGCATTGG AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA ?CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT
0 ?25 ?25
0 ?50 〉90
Cla I
CATCGATG ?GATCGATC CCATCGATGG CCCATCGATGGG
0 0 ?>90 50
0 0 ?>90 50
EcoR I
GGAATTCC ?CGGAATTCCG ?CCGGAATTCCGG
>90 ?>90 ?90
90 ?90 ?90
Hae III
GGGGCCCC AGCGGCCGCT TTGCGGCCGCAA
〉90 ?90 90
〉90 ?>90 90
Hind III
CAAGCTTG CCAAGCTTGG ?CCCAAGCTTGGG
0 0 10
0 0 ?75
Kpn I
GGGTACCC GGGGTACCCC ?CGGGGTACCCCG
0 ?〉90 ?90
0 90 ?〉90
Mlu I
GACGCGTC CGACGCGTCG
0 ?25
0 ?50
Nco I
CCCATGGG CATGCCATGGCATG
0 50
0 ?75
Nde I
CCATATGG CCCATATGGG CGCCATATGGCG ?GGGTTTCATATGAAACCC GGAATTCCATATGGAATTCC GGGAATTCCATATGGAATTCCC
0 ?0 0 ?0 ?75 75
0 0 ?0 0 ?>90 〉90
Nhe I
GGCTAGCC CGGCTAGCCG CTAGCTAGCTAG
0 ?10 ?10
0 ?25 ?50
?
酶
寡核苷酸序列
切割率%
2 hr
20 hr
Not I
TTGCGGCCGCAA ATTTGCGGCCGCTTTA AAATATGCGGCCGCTATAAA ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTAT ?AAGGAAAAAAGCGGCCGCAAAAGGAAAA
0 10 ?10 ?25 25
0 ?10 ?10 ?90 ?〉90
Nsi I
TGCATGCATGCA ?CCAATGCATTGGTTCTGCAGTT
10 ?90
90 ?90
Pac I
TTAATTAA GTTAATTAAC CCTTAATTAAGG
0 0 0
0 25 ?>90
Pme I
GTTTAAAC GGTTTAAACC ?GGGTTTAAACCC AGCTTTGTTTAAACGGCGCGCCGG
0 ?0 0 ?75
0 25 50 >90
Pst I
GCTGCAGC ?TGCACTGCAGTGCA AACTGCAGAACCAATGCATTGG AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT
0 10 90 90 0
0 ?10 ?>90 ?>90 ?0
Pvu I
CCGATCGG ATCGATCGAT ?TCGCGATCGCGA
0 10 0
0 25 ?10
Sac I
CGAGCTCG
10
10
Sac II
GCCGCGGC TCCCCGCGGGGA
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