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教学内容及过程
第03章 生物信息的传递(上) ——从DNA到RNA
希腊字母读音表
大写
小写
英文注音
国际音标注音
中文注音
Α
α
alpha
alfa
阿耳法
Β
β
beta
beta
贝塔
Γ
γ
gamma
gamma
伽马
Δ
δ
deta
delta
德耳塔
Ε
ε
epsilon
epsilon
艾普西隆
Ζ
ζ
zeta
zeta
截塔
Η
η
eta
eta
艾塔
Θ
θ
theta
θita
西塔
Ι
ι
iota
iota
约塔
Κ
κ
kappa
kappa
卡帕
Λ
λ
lambda
lambda
兰姆达
Μ
μ
mu
miu
缪
Ν
ν
nu
niu
纽
Ξ
ξ
xi
ksi
可塞
Ο
ο
omicron
omikron
奥密可戎
Π
π
pi
pai
派
Ρ
ρ
rho
rou
柔
Σ
σ
sigma
sigma
西格马
Τ
τ
tau
tau
套
Υ
υ
upsilon
jupsilon
衣普西隆
Φ
φ
phi
fai
斐
Χ
χ
chi
khai
喜
Ψ
ψ
psi
psai
普西
Ω
ω
omega
omiga
欧米伽
有关几个符号的意义,是国际生物化学命名委员会规定:
R = G,A Y = C,T
M = A,C K = G,T
W = A,T N = A,C,G,T
P = U, C
1 几个关于转录的观点和概念
转录(transcription) :生物体以DNA为模板合成RNA的过程 。DNA分子储藏的蛋白质遗传信息,必须转变为信使RNA(mRNA)分子后,才能到达蛋白质的合成工厂——核糖体,然蛋白质合成酶系统才能将mRNA带来的信息转译成蛋白质。在合成蛋白质过程中,还必须有能够携带氨基酸的tRNA和构成核糖体的rRNA。这三类RNA都必须以DNA为模板,在依赖于DNA的RNA聚合酶催化下合成,包括RNA链的起始、延伸、终止等重要步骤。这一系列过程就叫做转录(transcription)。
一般情况下,各种RNA都要由转录过程来合成即DNA→RNA,但是,在生物体内,转录并不是形成RNA的唯一途径。许多RNA病毒可以以其RNA为模板复制新的RNA即RNA→RNA,在还原病毒中还能以RNA为模板进行反转录,从而产生互补的DNA链即RNA→DNA。
参与转录的物质
原料: NTP (ATP, UTP, GTP, CTP)
模板:DNA
酶: RNA聚合酶
其他蛋白质因子
RNA合成方向:5 3
转录的连续性
RNA转录合成时,以DNA作为模板,在RNA聚合酶的催化下,连续合成一段RNA链,各条RNA链之间无需再进行连接。
合成的RNA中,如只含一个基因的遗传信息,称为单顺反子;如含有几个基因的遗传信息,则称为多顺反子。
转录的不对称性:
在RNA的合成中,DNA的二条链中仅有一条链可作为转录的模板,称为转录的不对称性。
编码链与模板链
与mRNA序列相同的那条DNA链称为编码链;将另一条根据碱基互补原则指导mRNA合成的DNA链称为模板链。
关于真核生物DNA两条链的命名:
有义链:又叫做编码链,指不作为模板转录的链
反义链:又叫做模板链,指作为模板转录的链,指导RNA合成的链
关于单链DNA病毒/噬菌体(M13 phage)
正链:单链噬菌体基因组的那条单链,
负链:单链噬菌体进入寄主后复制成双链,是以正链为模板复制了一个互补链,这条互补链叫做负链。
模板链并非永远在同一条单链上
结构基因::DNA分子上转录出RNA的区段,称为结构基因。
转录单元(transcription unit):一段从启动子开始至终止子结束的DNA序列。
转录的单向性:RNA转录合成时,只能向一个方向进行聚合,所依赖的模板DNA链的方向为3→5,而RNA链的合成方向为5→3。
2、转录的酶学―― RNA聚合酶
以E.coli为例: 该酶由5个亚基组成:α2ββ’σ。有时还看到另外一个亚基即ω,它的功能还不清楚。α2ββ’这样的整个酶分子称为核心酶,核心酶与σ亚基结合后称为全酶。σ的最主要的功能是识别启动子,β亚基的功能是参与同底物的结合并且催化磷酸二酯键的形成,β’亚基的功能是与有义链结合,α亚基可以参与全酶和启动子的结合。除了RNA聚合酶之外,转录还需要有其它的因子的参与,比如释放因子ρ等。
真核生物的RNA聚合酶
有三种:即 RNA聚合酶I、II、III。其中,
RNA聚合酶I存在于核仁中,其功能主要是负责合成5.8S rRNA, 18S rRNA, 28S rRNA;
RNA聚合酶II存在于核质中,负责合成mRNA和snRNA;
RNA聚合酶III也存在于核质中,
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