第9章 催化机制.pdfVIP

第9章 催化机制 国际象棋和酶都使用策略，国际象棋通过比赛来发展策略，而酶是通过进化来建立酶促反应 机制。右边是能够酶切肽键的活性位点，由三个氨基酸残基（化学键是白色）构成。用黑色 化学键表示的底物分子如同左边象棋比赛中已经落入圈套的国王，面临被裂解的命运。 酶催化效率和特异性的基础是什么？本章介绍四类酶促反应的机制，包括丝氨酸蛋白 酶、碳酸脱水酶、限制性核酸内切酶、和核苷单磷酸激酶。前三类酶催化的化学反应将水分 子加成到底物分子上，第四类酶要避免水分子的加成。经过大量的实验研究（包括蛋白质结 构测定、定点突变），这些酶的催化机制已经清楚。这些酶的催化机制阐述了很多重要的催 化原理。我们将看到，酶采用结合能、诱导匹配、和一些特殊的催化策略，协助底物形成转 化态。 每类酶采用的机制就是要解决各种化学反应所面临的问题。丝氨酸蛋白酶的例子是胰凝 乳蛋白酶，就是要将缺乏催化剂和 pH 7.0 几乎不发生的反应(蛋白质水解）进行下去。碳酸 脱水酶需要将化学反应加速到能够与其他快速生理过程融合的水平。而限制性内切酶如 EcoRV 要解决的问题是实现酶切反应的高度特异性。最后一类酶如 NMP 激酶，要解决的问 题是在