凝胶成象及图象分析系统.docxVIP

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凝胶成象及图象分析系统 分子生物学技术的实用性工具 凝胶成象系统的结构 凝胶成象的结构组成 硬件 –图象输入设备:暗箱、 CCD 摄影机、数码相机、扫描仪等–计算机:图象处理、图象分析–输出设备:打印机等 软件 –系统功能软件 图象处理 图象处理: (image processing) 计算机数字图象处理,是用计算机按不同目的对数字图象进行的修正、变换的一种技 术。 功能:改善图象质量,对于给定的原始图象消除其模糊因素,如 噪音、照明不均等;校正畸变,增强图象的反差。 增强对比度、改善背景、消除噪声、变换亮度、图片格式的转换 与图象处理有关的算法 图象分析  Sobel Laplacion 图象分析: (image analysis) 包括定量分析和定性分析两方面,计算机的图象分析一般是定量分析,是指用量化的方法以数字的表达形式对图象中各种结构信息的定量描述,在此基础上对图象所作的定量分析(半定量) 。 ? 在进行图象分析时,为提高图象质量,一般首先进行图象处理。 图象分析功能借助于计算机的图象分析系统 进行 。 图象定量分析的结构参数 几何参数 1 形态几何学参数 —— 面积、周长、最大径、最小径、长度等 2 区域几何学参数 —— 计数、面积百分比、区域内结构总面积、 1 被测区域面积。 光密度参数 光密度( OD )—— 又称吸光度,是光线通过介质前的入射光强度 I o与 透射光强度 I b 比值对数。 OD =log( I o /I b ) 积分光密度( IOD )—— 又称积分吸光度,是测量标本结构范围内各像素光密度之和 。 IOD =A*OD (A为被测面积) 适用范围 凝胶 1.琼脂糖凝胶 2.聚丙烯酰胺凝胶 ----- 湿胶片,干胶片 图片 扫描仪扫描图片、摄像机输入照片。 注意图片的储存格式与图象分析软件图形格式一致 凝胶成象的特点 影像优化:背景校正,反差,亮度调节,筛选,倒置,裁剪,对焦,加注,编辑,打印,储存,装载等 易操作暗箱,摄像机接口,紫外保护观察窗口,光透射仪,高强度光源,光强度可调,紫外光和白光可转换 能够同时输出图象信息和测量信息,即时性强 可以对不同来源的图象进行处理 与国际接轨 凝胶成象系统的种类 荧光成象系统 化学发光成象系统 磷屏成象系统 通用型系统 图像分析软件介绍 1D 凝胶电泳等 2D 双向电泳 序列分析 平板胶测序 RFLP-PCR 限制性片段长度多态性分析 颗粒计数 2 同源性比较 CLUSTER 核型分析 DOTS ELISA 骨密度分析 显微图像分析 FISH 原位杂交图像分析 网络获取软件 —— 生物软件网 3

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