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高温胁迫下棉花花药组蛋白H3K4me3 和H3K27me3 修饰变化比较分析 目录 摘要 i Abstract iii 缩略语表 vi 1 文献综述 1 前言 1 1.1 表观调控和表观遗传学2 1.2 组蛋白修饰2 1.2.1 组蛋白甲基化修饰2 1.2.2 组蛋白其他修饰3 1.3 组蛋白甲基化参与植物生长发育4 1.3.1 H3K4me3 修饰影响植物生长发育4 1.3.2 H3K27me3 修饰影响植物生长发育5 1.4 组蛋白甲基化H3K4me3 和H3K27me3 响应环境变化6 1.5 组蛋白H3K4 和H3K27 甲基转移酶和去甲基酶6 1.5.1 组蛋白H3K4 甲基转移酶和去甲基酶7 1.5.2 组蛋白H3K27 甲基转移酶和去甲基酶8 1.6 高温胁迫影响雄性器官的发育9 1.6.1 高温胁迫下糖代谢异常影响雄性器官的发育 10 1.6.2 高温胁迫改变生长素含量进而影响雄性器官的发育 11 1.7 本研究的目的和意义 12 2 材料和方法 13 2.1 试验材料 13 2.2 实验试剂 13 2.3 花药表型的观察 13 2.4 花粉活性检测 13 2.5 棉花组织RNA 的提取 14 2.6 RNA 反转录 15 2.7 qRT-PCR 15 I 华中农业大学2020 届硕士研究生学位（毕业）论文 2.8 染色质免疫共沉淀 16 2.9 染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)高通量测序建库及数据分析方法 18 2.10 转录组测序(RNA-seq)数据分析 19 2.11 GO(Gene Ontology)显著性分析 19 3 结果与分析20 3.1 ‘84021’和‘H05’花药表型观察及花粉TTC 染色20 3.2 棉花花药染色质免疫共沉淀（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP ）22 3.3 染色质免疫共沉淀生物学重复皮尔森相关性分析24 3.4 棉花花药H3K4me3 和H3K27me3 全基因组分布分析25 3.5 棉花花药H3K4me3 和H3K27me3 修饰位点分布分析26 3.6 棉花花药H3K4me3 和H3K27me3 修饰与基因表达之间的关系分析29 3.7 棉花花药中高量表达H3K4me3 和 H3K27me3 甲基转移酶和去甲基酶基 因筛选30 3.8 H3K4me3 和 H3K27me3 甲基转移酶和去甲基酶基因高温诱导表达分析 32 3.9 gene body 区域H3K4me3 和H3K27me3 修饰富集分析34 3.10 高温导致基因本体H3K27me3 修饰丢失36 3.11 高温后丢失H3K27me3 修饰的基因的GO 分析38 3.12 ‘84021’高温后丢失 H3K27me3 修饰在绒毡层降解时期和花药开裂时期 共同富集路径基因表达分析41 3.13 果胶甲酯酶相关基因高温诱导表达分析46 4 讨论48 4.1 棉花花药中H3K27me3 可能主要影响基因间区来调控基因功能48 4.2 H3K4me3-H3K27me3 修饰可能共同调控花药中基因的表达及对高温胁迫 的响应48 4.3 H3K27me3 修饰可能参与棉花花药的DNA 甲基化水平49 4.4 苹果酸转运蛋白ALMT 基因可能参与花药的高温胁迫响应50