黄瓜HD-ZIP转录因子家族的鉴定及表达分析.pdfVIP

摘要 摘 要 HD-Zip 转录因子是植物中特有的一类转录因子，在高等植物的生长发育以及生 物和非生物胁迫等逆境应答中起着重要的调控作用。根据其结构、保守序列和功能特 性，可将 HD-ZIP 分为四个亚家族（HD-Zip I 、HD-Zip II 、HD-Zip III 和 HD-Zip IV ）。 在本研究中，从黄瓜基因组数据库中鉴定了来自四个亚家族的 40 个 HD-ZIP （CsHDZ ） 基因，并进行了系统发育分析、保守基序分析、染色体定位和转录组分析。此外，从 HD-ZIP 中选择了 11 个成员进行实时定量 PCR 表达分析，研究了这 11 个基因在非生 物胁迫、生物胁迫和激素处理下的表达量，并且在烟草表皮细胞中进行了 CsHDZ22 的亚细胞定位。研究结果可为进一步解析黄瓜 HD-ZIP 家族基因的生物学功能和作用 机理提供了一定的参考价值。关于这项研究主要结果如下： 1.从黄瓜基因组数据库中鉴定了40 个编码 HD-Zip 蛋白的 CsHDZ 基因，并将这些 基因依据染色体上的位置，命名为 CsHDZ1-CsHDZ40。CsHDZ 基因大部分位于细胞 核，而 CsHDZ05、CsHDZ11、CsHDZ19、CsHDZ30、CsHDZ36、CsHDZ40 基因位于 质膜中，CsHDZ13 基因位于细胞外。 2.为了深入了解黄瓜、水稻和拟南芥 HD-Zip 蛋白进化关系，利用 40 个 CsHDZ、 47 个 AtHDZ 和 48 个 OsHDZ 基因氨基酸序列来构建系统发育树。另外，将 HD-ZIP 蛋 白分为HD-ZIP I 、HD-ZIP II 、HD-ZIP III 和 HD-ZIP III 四个亚家族，并统计了每个亚 家族中黄瓜 HD-ZIP 蛋白的数量。在四个亚家族中，HD-ZIP I 亚家族是最大的亚家族， 共 13 个基因，其次是 HD-ZIP III 有 5 个基因，HD-ZIP II 和 HD-ZIP IV 各 11 个基因。 3. 热图数据显示，CsHDZ 基因在所有组织中均有表达，表明其参与了各种发育过 程。生物功能预测结果表明，CsHDZ 基因参与许多生物学过程，如对环境刺激的反应， 发育活动，代谢活动，激素反应等。 4. 在热、冷、干旱、盐等非生物胁迫下对 11 个 CsHDZ 基因的表达进行分析，结 果显示在大部分胁迫条件下，基因表达均呈现出上调趋势。在激素（IAA 和 ABA ） 处理下的基因表达呈现差异表达趋势。此外，在白粉菌侵染下，除 CsHDZ08 、 CsHDZ11、CsHDZ22 和 CsHDZ36 外，CsHDZ 基因表达量均有所上升。 5. 对 CsHDZ22 基因在烟草表皮细胞中的亚细胞定位进行分析 ，结果表明 CSHDZ22 位于细胞核中。 根据上述结果，推测黄瓜基因组中的 CsHDZ 基因在调节黄瓜对非生物胁迫的抗 性中发挥着重要作用，并为其功能研究提供了线索。 关键词：HD-ZIP ，非生物胁迫，基因表达，黄瓜 I 目 录 目 录 摘要I 1. 文献综述 1 1.1 HD-ZIP 基因家族研究进展 1 1.2 HD-ZIP 基因家族结构特征 1 1.3 HD-ZIP 基因家族在植物生长发育中的作用 3 1.4 HD-ZIP 基因家族在非生物胁迫调控中的作用 6 1.4.1 HD-ZIP I 亚家族在非生物胁迫调控中的作用 6 1.4.2 Role of HD-ZIP II 亚家族在非生物胁迫调控中的作用 9 1.4.3 HD-ZIP III 亚家族在非生物胁迫调控中的作用 10 1.5 HD-ZIP 基因家族在生物胁迫调控中的作用 14 1.5.1 HD-ZIP I 在应对生物胁迫中的作用 14