NMR技术在蛋白质动力学研究中的应用.pdf

NMR技术在蛋白质动力学研究中的应用 蛋白质相互作用动力学的研究有助于系统地了解蛋白质结构与功能的关系， 并为新药靶点的发现和药物设计提供理论和实验基础。在这方面的研究中，NMR 技术具有独特的优越性，是目前研究溶液中蛋白质等生物大分子的三维结构、主 链和侧链运动特征及其与相互作用和功能的关系(构效关系)最为有效的手段。借 助核磁共振波谱实验技术，不但能以非常高的时间和空间分辨率观察到蛋白质分 子内部的运动情况，还可对蛋白质动力学特征进行研究，这为进一步了解蛋白质 的功能提供了崭新手段。 Wagner 和WÜthrich 等人研究了某一球状蛋白质 （globular protein）分子里 1 芳香族氨基酸残基（aromaticresidues）中 H 的一维（one-dimensional，1D）NMR 波谱图发现，在蛋白质分子内部疏水核心区，芳香族氨基酸残基的侧链发生了转 动。这一研究结果表明，蛋白质分子实际上是处于不断“运动”状态中的，同时， 该结果也进一步支持了之前的X 射线衍射 （x-ray diffraction）实验结果。现在， 人们知道蛋白质动力学和蛋白质功能之间有着非常紧密的联系。比如，蛋白质动 力学对维持蛋白质活性状态的热力学稳定性非常有帮助，在蛋白质发挥催化活性 的过程中也起到了重要作用——正是因为蛋白质可以“运动”，才会暴露出关键的 催化位点；在配体结合反应中，蛋白质分子暴露出配体结合位点；在分子识别过 程中，蛋白质从无序状态调整到有序状态；在异构调节中改变构象从而在蛋白质 分子间传递信息等等。NMR 波谱技术非常适合研究上述各种蛋白质动力学过程， 因为可以从各种时间跨度内的蛋白质运动情况（从只有皮秒级的化学键振动到长 达数秒的各种蛋白质运动）中捕捉到蛋白质分子的位点特异性信息 （site-specific information）。在检测分子结构时，化学位移是非常敏感的信号，利用NMR 波谱 技术，可望找到所有“看不见的”蛋白质活化状态，得到更多更完整的蛋白质结构 信息。